33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1844 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1844  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  441  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2179  hypothetical protein  96.61 
 
 		 236 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1795  hypothetical protein  83.04 
 
 		 223 aa  270  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2723  hypothetical protein  58.77 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.214242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5319  hypothetical protein  55.34 
 
 		 238 aa  175  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5015  hypothetical protein  59.09 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0020  hypothetical protein  43.17 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  47.66 
 
 		 396 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1243  hypothetical protein  43.81 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1579  hypothetical protein  39.17 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000182235  unclonable  0.000000174169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4098  hypothetical protein  42.37 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2618  hypothetical protein  40.35 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0343997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3141  hypothetical protein  37.23 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3073  hypothetical protein  37.85 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2456  hypothetical protein  37.5 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0904442  normal  0.102517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1676  hypothetical protein  33.19 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1101  hypothetical protein  30.34 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1569  hypothetical protein  32.62 
 
 		 229 aa  85.1  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.862522  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6499  hypothetical protein  38.12 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670361  normal  0.0462955 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0348  hypothetical protein  33.03 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.773589  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1586  hypothetical protein  30.8 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.193654  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0176  hypothetical protein  31.25 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1383  hypothetical protein  32.19 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2061  hypothetical protein  34.05 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0868  hypothetical protein  31.7 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1735  hypothetical protein  30.36 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.370565 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0482  hypothetical protein  28.57 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2631  hypothetical protein  33.77 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5939  hypothetical protein  35.75 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471017  normal  0.0147378 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1240  hypothetical protein  26.61 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1717  hypothetical protein  33.79 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.757154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3577  dihydroneopterin aldolase  33.06 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0954558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2711  hypothetical protein  28.57 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>