64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0517 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0517  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 		 150 aa  305  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4088  dihydroneopterin aldolase  88.62 
 
 		 123 aa  219  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0495  dihydroneopterin aldolase  88.62 
 
 		 123 aa  218  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0418913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0506  dihydroneopterin aldolase  88.98 
 
 		 130 aa  211  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.250625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1249  dihydroneopterin aldolase  82.93 
 
 		 123 aa  207  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4226  dihydroneopterin aldolase  86.44 
 
 		 125 aa  204  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265361 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0814  dihydroneopterin aldolase  83.9 
 
 		 130 aa  202  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0975  dihydroneopterin aldolase  80.51 
 
 		 124 aa  194  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1464  dihydroneopterin aldolase  79.66 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2893  dihydroneopterin aldolase  31.03 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0147229 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0553  dihydroneopterin aldolase  27.83 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6328  dihydroneopterin aldolase  31.58 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0507  dihydroneopterin aldolase  30.48 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2999  dihydroneopterin aldolase  29.82 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2365  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2979  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0047  dihydroneopterin aldolase  27.36 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1194  dihydroneopterin aldolase  34.34 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0050  hypothetical protein  27.36 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2974  dihydroneopterin aldolase  31.3 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1994  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0183  dihydroneopterin aldolase  26.5 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0157  hypothetical protein  28.97 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1280  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000396962  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1709  dihydroneopterin aldolase  29.03 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0601  dihydroneopterin aldolase  25.93 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0520  dihydroneopterin aldolase  29.1 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0116  dihydroneopterin aldolase  32.71 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2194  dihydroneopterin aldolase  32.99 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343507  normal  0.0385809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0226  dihydroneopterin aldolase  24.32 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476731  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2066  dihydroneopterin aldolase  31.13 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000254048  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2889  dihydroneopterin aldolase  30.43 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0630  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  28.32 
 
 		 525 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00284446  normal  0.33156 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3026  dihydroneopterin aldolase  30.43 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0291  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3382  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000214266  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2219  dihydroneopterin aldolase family protein  30.11 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.413357  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2246  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.870734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0341  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0123637  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0328  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2038  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617324  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0102  dihydroneopterin aldolase  26.88 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000152053 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3055  dihydroneopterin aldolase  29.57 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.379291  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3731  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2984  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  28.32 
 
 		 612 aa  45.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.261755  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1861  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 		 300 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0326  dihydroneopterin aldolase  29.31 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1208  dihydroneopterin aldolase  26.26 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0647  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 		 311 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0510  dihydroneopterin aldolase  37.29 
 
 		 300 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0205  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0541  dihydroneopterin aldolase  32.14 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0233  dihydroneopterin aldolase family protein  32.97 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1246  dihydroneopterin aldolase  26.26 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0419783  normal  0.0387955 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  29.47 
 
 		 470 aa  43.9  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0534  dihydroneopterin aldolase  30.61 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0193  dihydroneopterin aldolase  30.97 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.600595  normal  0.861328 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6489  dihydroneopterin aldolase  32.69 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal  0.299882 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  30 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  30 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2728  dihydroneopterin aldolase, putative  30 
 
 		 312 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2481  dihydroneopterin aldolase  29.2 
 
 		 143 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2307  dihydroneopterin aldolase  36.84 
 
 		 306 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  30.3 
 
 		 292 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>