64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1105 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1105  putative dihydroneopterin aldolase protein  100 
 
 		 148 aa  301  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0652019 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0050  dihydroneopterin aldolase protein  85.31 
 
 		 148 aa  248  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.333403 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4826  dihydroneopterin aldolase  79.45 
 
 		 148 aa  239  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0490  dihydroneopterin aldolase  74.1 
 
 		 146 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5065  dihydroneopterin aldolase  72.66 
 
 		 146 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3508  dihydroneopterin aldolase  71.94 
 
 		 146 aa  209  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5132  dihydroneopterin aldolase  71.22 
 
 		 146 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.659907  normal  0.775541 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5147  dihydroneopterin aldolase  70.5 
 
 		 146 aa  206  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3220  dihydroneopterin aldolase  70.5 
 
 		 146 aa  206  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4542  dihydroneopterin aldolase  71.63 
 
 		 148 aa  205  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1000  dihydroneopterin aldolase, putative  71.33 
 
 		 153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1858  dihydroneopterin aldolase  70.42 
 
 		 153 aa  192  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0487  putative dihydroneopterin aldolase  70.42 
 
 		 153 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0163  putative dihydroneopterin aldolase  70.42 
 
 		 153 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1447  putative dihydroneopterin aldolase  70.42 
 
 		 153 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0391  dihydroneopterin aldolase, putative  70.42 
 
 		 153 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0894  putative dihydroneopterin aldolase  70.42 
 
 		 153 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1950  dihydroneopterin aldolase  70.42 
 
 		 153 aa  191  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373472  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3329  dihydroneopterin aldolase  64.62 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.46532 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2219  dihydroneopterin aldolase family protein  33.04 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.413357  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3146  dihydroneopterin aldolase  35.04 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0601  dihydroneopterin aldolase  32.14 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3078  dihydroneopterin aldolase  33.04 
 
 		 143 aa  50.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0725  dihydroneopterin aldolase  33.93 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0126  dihydroneopterin aldolase  34.82 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0126  dihydroneopterin aldolase  34.82 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.22005  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  33.02 
 
 		 470 aa  47.8  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4345  dihydroneopterin aldolase  36.25 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0534  dihydroneopterin aldolase  29.46 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0553  dihydroneopterin aldolase  32.14 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2011  hypothetical protein  28.72 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1298  dihydroneopterin aldolase  24.32 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1182  dihydroneopterin aldolase  29.73 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  28.95 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2006  hypothetical protein  28.72 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2345  dihydroneopterin aldolase  31.86 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0329  dihydroneopterin aldolase  30.17 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83425 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2381  dihydroneopterin aldolase  29.2 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0507  dihydroneopterin aldolase  30.89 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0965  dihydroneopterin aldolase  28.32 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0312148  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2328  dihydroneopterin aldolase  27.68 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00313661  normal  0.014777 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1194  dihydroneopterin aldolase  27.83 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0172  dihydroneopterin aldolase  27.43 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0620  dihydroneopterin aldolase  25.89 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  32.18 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2066  dihydroneopterin aldolase  27.59 
 
 		 117 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000254048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5144  dihydroneopterin aldolase family protein  29.2 
 
 		 118 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2913  dihydroneopterin aldolase  33.75 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0397  dihydroneopterin aldolase  31.25 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.294634  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4340  dihydroneopterin aldolase  27.68 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13639  dihydroneopterin aldolase folB  32.98 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  hitchhiker  0.00236264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  28.33 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46950  Dihydroneopterin aldolase  29.2 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1208  dihydroneopterin aldolase  27.03 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2893  dihydroneopterin aldolase  27.97 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0147229 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0193  dihydroneopterin aldolase  26.79 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.600595  normal  0.861328 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4636  dihydroneopterin aldolase  31.65 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6489  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal  0.299882 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5153  dihydroneopterin aldolase  31.91 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  31.91 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  31.91 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04103  dihydroneopterin aldolase  27.59 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2481  dihydroneopterin aldolase  27.87 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0542  dihydroneopterin aldolase  31.65 
 
 		 117 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>