41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5065 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5065  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
146 aa  300  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5132  dihydroneopterin aldolase  98.63 
 
 
146 aa  298  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.659907  normal  0.775541 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3220  dihydroneopterin aldolase  97.95 
 
 
146 aa  296  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5147  dihydroneopterin aldolase  97.95 
 
 
146 aa  296  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451555  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4542  dihydroneopterin aldolase  98.65 
 
 
148 aa  295  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0490  dihydroneopterin aldolase  96.58 
 
 
146 aa  294  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3508  dihydroneopterin aldolase  91.78 
 
 
146 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4826  dihydroneopterin aldolase  75.18 
 
 
148 aa  228  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0391  dihydroneopterin aldolase, putative  74.48 
 
 
153 aa  224  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1447  putative dihydroneopterin aldolase  74.48 
 
 
153 aa  224  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0163  putative dihydroneopterin aldolase  74.48 
 
 
153 aa  224  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0487  putative dihydroneopterin aldolase  74.48 
 
 
153 aa  224  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0894  putative dihydroneopterin aldolase  74.48 
 
 
153 aa  224  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1858  dihydroneopterin aldolase  74.48 
 
 
153 aa  223  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1950  dihydroneopterin aldolase  74.48 
 
 
153 aa  223  8e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373472  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1000  dihydroneopterin aldolase, putative  71.43 
 
 
153 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0050  dihydroneopterin aldolase protein  71.83 
 
 
148 aa  211  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.333403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1105  putative dihydroneopterin aldolase protein  72.66 
 
 
148 aa  210  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0652019 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3329  dihydroneopterin aldolase  69.6 
 
 
137 aa  184  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.46532 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0601  dihydroneopterin aldolase  32.14 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2219  dihydroneopterin aldolase family protein  32.56 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.413357  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0126  dihydroneopterin aldolase  31.4 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.22005  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0126  dihydroneopterin aldolase  31.4 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280632  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2893  dihydroneopterin aldolase  30.23 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0147229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2328  dihydroneopterin aldolase  28.57 
 
 
124 aa  44.3  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00313661  normal  0.014777 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0205  dihydroneopterin aldolase  29.32 
 
 
131 aa  43.5  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3731  dihydroneopterin aldolase  29.32 
 
 
131 aa  43.5  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030825  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2381  dihydroneopterin aldolase  25.66 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1194  dihydroneopterin aldolase  27.83 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0183  dihydroneopterin aldolase  27.56 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  25 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2063  dihydroneopterin aldolase  29.66 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.424168  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1812  dihydroneopterin aldolase  23.28 
 
 
120 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109072  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0725  dihydroneopterin aldolase  29.46 
 
 
117 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0236  dihydroneopterin aldolase  32.71 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0723  dihydroneopterin aldolase  25.89 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  27.97 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  31.4 
 
 
470 aa  40.8  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1182  dihydroneopterin aldolase  30.63 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1046  dihydroneopterin aldolase  26.32 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0337595  normal  0.538227 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0507  dihydroneopterin aldolase  25.76 
 
 
137 aa  40  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>