62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0050 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0050  dihydroneopterin aldolase protein  100 
 
 		 148 aa  299  8.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.333403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1105  putative dihydroneopterin aldolase protein  85.31 
 
 		 148 aa  248  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0652019 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4826  dihydroneopterin aldolase  79.31 
 
 		 148 aa  238  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5065  dihydroneopterin aldolase  71.83 
 
 		 146 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5132  dihydroneopterin aldolase  70.42 
 
 		 146 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.659907  normal  0.775541 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0490  dihydroneopterin aldolase  71.13 
 
 		 146 aa  209  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3508  dihydroneopterin aldolase  69.01 
 
 		 146 aa  206  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5147  dihydroneopterin aldolase  69.72 
 
 		 146 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4542  dihydroneopterin aldolase  70.83 
 
 		 148 aa  206  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3220  dihydroneopterin aldolase  69.72 
 
 		 146 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1000  dihydroneopterin aldolase, putative  68.21 
 
 		 153 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1858  dihydroneopterin aldolase  69.01 
 
 		 153 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1447  putative dihydroneopterin aldolase  69.01 
 
 		 153 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0163  putative dihydroneopterin aldolase  69.01 
 
 		 153 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0487  putative dihydroneopterin aldolase  69.01 
 
 		 153 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0894  putative dihydroneopterin aldolase  69.01 
 
 		 153 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0391  dihydroneopterin aldolase, putative  69.01 
 
 		 153 aa  191  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1950  dihydroneopterin aldolase  69.01 
 
 		 153 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373472  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3329  dihydroneopterin aldolase  66.4 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.46532 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2219  dihydroneopterin aldolase family protein  33.93 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.413357  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0601  dihydroneopterin aldolase  32.14 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0126  dihydroneopterin aldolase  31.25 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.22005  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0126  dihydroneopterin aldolase  31.25 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  30.7 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  31.4 
 
 		 470 aa  48.1  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0329  dihydroneopterin aldolase  31.03 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.83425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  33.02 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0725  dihydroneopterin aldolase  32.14 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0172  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2381  dihydroneopterin aldolase  31.37 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1182  dihydroneopterin aldolase  28.83 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1194  dihydroneopterin aldolase  28.7 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  29.17 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0534  dihydroneopterin aldolase  29.46 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2011  hypothetical protein  26.6 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0620  dihydroneopterin aldolase  31.25 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4345  dihydroneopterin aldolase  35 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1298  dihydroneopterin aldolase  25.23 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0663  dihydroneopterin aldolase  30.77 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04103  dihydroneopterin aldolase  29.31 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2006  hypothetical protein  26.6 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3078  dihydroneopterin aldolase  30.43 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1046  dihydroneopterin aldolase  29.73 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0337595  normal  0.538227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8421  dihydroneopterin aldolase  31.3 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3146  dihydroneopterin aldolase  32.5 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001617  dihydroneopterin aldolase  29.31 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.156687  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  29.91 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0052  putative dihydroneopterin aldolase FolB  29.06 
 
 		 129 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148451  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4340  dihydroneopterin aldolase  29.46 
 
 		 123 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00855  hypothetical protein  28.45 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0965  dihydroneopterin aldolase  27.43 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0312148  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0723  dihydroneopterin aldolase  26.79 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0553  dihydroneopterin aldolase  31.53 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0507  dihydroneopterin aldolase  29.13 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1802  dihydroneopterin aldolase  27.12 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0971  dihydroneopterin aldolase  31.19 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.547103  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0193  dihydroneopterin aldolase  27.68 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.600595  normal  0.861328 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13639  dihydroneopterin aldolase folB  31.91 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  hitchhiker  0.00236264 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1734  dihydroneopterin aldolase  29.06 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2066  dihydroneopterin aldolase  28.45 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000254048  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1078  dihydroneopterin aldolase  26.79 
 
 		 117 aa  40  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130702  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3534  dihydroneopterin aldolase  27.27 
 
 		 125 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0920565  normal  0.287945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>