34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3438 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3438  1-pyrroline-5-carboxylate synthetase  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0400881 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1317  aspartate/glutamate/uridylate kinase  50.91 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2447  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.79 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.952471  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.83 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal  0.701682 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0494  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.17 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0839  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.67 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1384  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.8 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1274  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.73 
 
 		 212 aa  105  8e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000302889  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0644  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.22 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0413219  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0179  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.55 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000583538  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2346  1-pyrroline-5-carboxylate synthetase  31.65 
 
 		 191 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0710  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.08 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.155359  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0628  hypothetical protein  38.67 
 
 		 170 aa  90.5  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4102  amino acid kinase family protein  31.67 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2619  uncharacterized kinase  31.06 
 
 		 202 aa  72  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0138067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1843  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.29 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0254  amino acid kinase family protein  28.57 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5938  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein, putative kinase  37.16 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.0234178 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2871  amino acid kinase family protein  36.18 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6500  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.49 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0428834 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2332  Uncharacterized aspartokinase uridylate kinase-like protein  34.81 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.428071  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1647  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.79 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000510531  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2457  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein, putative kinase  34.46 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330903  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1794  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.58 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.453812  normal  0.620539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5016  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.19 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.761647  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2178  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.55 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2724  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5320  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.71 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3140  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.34 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2395  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.62 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3071  aspartokinase uridylate kinase-like putative kinase  34.38 
 
 		 139 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1041  acetylglutamate kinase  29.63 
 
 		 282 aa  44.3  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0274311  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1071  acetylglutamate kinase  28.7 
 
 		 282 aa  42.7  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0437011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2137  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.13 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0520229  decreased coverage  0.00000787981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>