41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2137 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2137  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 		 224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0520229  decreased coverage  0.00000787981 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1044  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.42 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0475  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.07 
 
 		 248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.604856  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1420  amino acid kinase  33.47 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187452  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1763  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.62 
 
 		 257 aa  99  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0918  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.41 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.919268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1026  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.83 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0314  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.85 
 
 		 247 aa  90.9  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.96916 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.83 
 
 		 257 aa  89.7  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1031  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.79 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0149  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.82 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1813  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.89 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0423  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.89 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0180  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.51 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.255943 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2889  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.22 
 
 		 256 aa  78.2  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00536042  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0682  helix-turn-helix domain-containing protein  30.24 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1207  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.44 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.646122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2396  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.13 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000247206  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2540  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0164  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.5 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2212  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.87 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0440  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.24 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.2273  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2375  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.99 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.307477  normal  0.44682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2247  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.13 
 
 		 269 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000037352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4059  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.04 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000196587  normal  0.0625041 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0725  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.2 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0816723  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0607  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.77 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255147  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2605  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.52 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198321  normal  0.303854 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1001  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.19 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.56233  normal  0.37814 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2046  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.71 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.45743  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1830  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.17 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  27.47 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  27.47 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2285  aspartate/glutamate/uridylate kinase  23.93 
 
 		 267 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000652943  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  30.49 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  30.67 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  30.67 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3438  1-pyrroline-5-carboxylate synthetase  29.13 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0400881 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0229  acetylglutamate kinase  30.89 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0059376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  26.97 
 
 		 242 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2386  uridylate kinase  33.72 
 
 		 268 aa  41.6  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.802310000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>