More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2386 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2386  uridylate kinase  100 
 
 		 268 aa  533  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.802310000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0932  putative uridylate kinase  79.1 
 
 		 268 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1531  aspartate/glutamate/uridylate kinase  73.51 
 
 		 268 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.215337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2625  aspartate/glutamate/uridylate kinase  70.52 
 
 		 268 aa  378  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0024261  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1890  aspartate/glutamate/uridylate kinase  64.04 
 
 		 268 aa  362  3e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0516  aspartate/glutamate/uridylate kinase  62.96 
 
 		 271 aa  352  2e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.316838  normal  0.700434 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0688  hypothetical protein  56.06 
 
 		 273 aa  284  8e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.512522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2454  uridylate kinase  47.55 
 
 		 277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2394  aspartate/glutamate/uridylate kinase  46.24 
 
 		 276 aa  246  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1627  aspartate/glutamate/uridylate kinase  47.23 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0949  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.23 
 
 		 269 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.560652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0638  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.91 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0277  aspartate/glutamate/uridylate kinase  45.56 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.366502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0348  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.46 
 
 		 279 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0355  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.46 
 
 		 279 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1574  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.38 
 
 		 270 aa  211  7e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2956  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.76 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3843  molybdenum storage protein beta subunit  42.15 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43210  Molybdenum storage protein beta subunit, MosB  45.76 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  44.49 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1693  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.61 
 
 		 270 aa  199  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0354  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.13 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0347  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.13 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2954  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.64 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3842  molybdenum storage protein alpha subunit  38.78 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1694  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.64 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.06 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.406129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43200  Molybdenum storage protein subunit A  38.55 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0637  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.12 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0592  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.84 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1575  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.97 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1626  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.21 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  26.23 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  31.94 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  32.69 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2844  uridylate kinase  33.98 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000917545  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  36.89 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  36.79 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5909  uridylate kinase  34.62 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.166242  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  34.62 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  28.05 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12897  uridylate kinase  35.58 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1673  uridylate kinase  35.24 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1721  uridylate kinase  25.31 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0977  uridylate kinase  35.24 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111069  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1540  uridylate kinase  34.95 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10140  uridylate kinase  31.43 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.956696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1531  uridylate kinase  34.23 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0482358 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1006  uridylate kinase  37.14 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  33.98 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  27.85 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  33.98 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  35.24 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2110  uridylate kinase  33.02 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01375  uridylate kinase  32.69 
 
 		 155 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00470454  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06760  uridylate kinase  34.58 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000401703  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2505  uridylate kinase  37.14 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.234958 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  34.95 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  33.98 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  34.95 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1369  uridylate kinase  33.33 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.237197  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  33.98 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  34.95 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1984  uridylate kinase  35.58 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  33.98 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1555  uridylate kinase  32.04 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  33.98 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2003  uridylate kinase  35.58 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  33.98 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4124  uridylate kinase  32.69 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  34.26 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2049  uridylate kinase  35.58 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  33.01 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  33.98 
 
 		 247 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  33.98 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  33.01 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  33.01 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  33.01 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  25.69 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  31.43 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2220  uridylate kinase  34.62 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118147  normal  0.160064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  33.01 
 
 		 242 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  36.36 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1486  uridylate kinase  34.29 
 
 		 251 aa  52.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.891753  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1047  uridylate kinase  39.62 
 
 		 257 aa  52.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.309878  normal  0.307589 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  32.69 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1386  uridylate kinase  33.33 
 
 		 245 aa  52  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000273157 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  33.98 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  33.98 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3989  uridylate kinase  34.29 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  32.69 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  33.98 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  32.04 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  25 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  29.52 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  29.52 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3111  uridylate kinase  32.69 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000029028  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  32.04 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  25.85 
 
 		 236 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  29.52 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>