52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0475 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0475  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 
248 aa  484  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.604856  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2396  aspartate/glutamate/uridylate kinase  47.58 
 
 
257 aa  202  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000247206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1420  amino acid kinase  45.75 
 
 
260 aa  193  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187452  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0682  helix-turn-helix domain-containing protein  42.91 
 
 
251 aa  170  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2212  aspartate/glutamate/uridylate kinase  44.1 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1813  aspartate/glutamate/uridylate kinase  45.37 
 
 
254 aa  152  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2375  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.17 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.307477  normal  0.44682 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2889  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.56 
 
 
256 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00536042  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1031  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.09 
 
 
261 aa  142  5e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1763  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.69 
 
 
257 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0918  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.08 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.919268  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1026  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.31 
 
 
257 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0607  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.6 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255147  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2247  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.96 
 
 
269 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000037352  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.77 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0423  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.88 
 
 
264 aa  115  5e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2137  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.07 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0520229  decreased coverage  0.00000787981 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2540  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.29 
 
 
250 aa  111  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2605  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.35 
 
 
250 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198321  normal  0.303854 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0149  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.29 
 
 
240 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1207  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.78 
 
 
238 aa  99.8  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.646122  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4059  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.27 
 
 
269 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000196587  normal  0.0625041 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2046  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.7 
 
 
244 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.45743  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2285  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.63 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000652943  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0440  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.08 
 
 
254 aa  94  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.2273  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0164  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.56 
 
 
238 aa  93.2  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3216  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.78 
 
 
268 aa  92.4  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00631129  normal  0.219894 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0180  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.78 
 
 
242 aa  92.8  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.255943 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0725  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.49 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0816723  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1166  aspartate/glutamate/uridylate kinase  26.95 
 
 
279 aa  87.8  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0314  aspartate/glutamate/uridylate kinase  26.19 
 
 
247 aa  86.3  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.96916 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1044  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.89 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1830  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.69 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3036  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92808  predicted protein  27.78 
 
 
380 aa  65.9  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1001  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.31 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.56233  normal  0.37814 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0277  acetylglutamate/acetylaminoadipate kinase  26.77 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0302833  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0372  acetylglutamate/acetylaminoadipate kinase  27.45 
 
 
261 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1836  acetylglutamate/acetylaminoadipate kinase  25.84 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0967  acetylglutamate/acetylaminoadipate kinase  27.45 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120356  hitchhiker  0.00000000299436 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0058  acetylglutamate kinase  29.13 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1414  gamma-glutamyl kinase  25.85 
 
 
356 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1575  gamma-glutamyl kinase  27.15 
 
 
356 aa  46.2  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1134  acetylglutamate kinase  20.91 
 
 
264 aa  46.2  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.508779  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1290  acetylglutamate kinase  21.29 
 
 
267 aa  45.4  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0327535 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1300  acetylglutamate kinase  23.96 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0361901  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0277  acetylglutamate kinase  25.6 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0251  acetylglutamate kinase  25.6 
 
 
279 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0350  acetylglutamate kinase  28.21 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201879 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0224  acetylglutamate kinase  25.6 
 
 
279 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1090  acetylglutamate kinase  23.78 
 
 
245 aa  43.9  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.171552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4143  acetylglutamate kinase  28.77 
 
 
248 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2721  gamma-glutamyl kinase  30.26 
 
 
385 aa  42  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>