76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4059 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4059  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 
269 aa  537  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000196587  normal  0.0625041 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2247  aspartate/glutamate/uridylate kinase  81.41 
 
 
269 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000037352  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3216  aspartate/glutamate/uridylate kinase  60.15 
 
 
268 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00631129  normal  0.219894 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2285  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.97 
 
 
267 aa  205  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000652943  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0607  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.73 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255147  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0423  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.63 
 
 
264 aa  122  8e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2396  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.22 
 
 
257 aa  112  9e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000247206  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0149  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.73 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1031  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.5 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1813  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.67 
 
 
254 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.45 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0180  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.5 
 
 
242 aa  109  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.255943 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0475  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.7 
 
 
248 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.604856  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2889  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.93 
 
 
256 aa  105  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00536042  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0918  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.41 
 
 
257 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.919268  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0164  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36 
 
 
238 aa  104  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1763  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.21 
 
 
257 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1026  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.68 
 
 
257 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0682  helix-turn-helix domain-containing protein  32.47 
 
 
251 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1420  amino acid kinase  31.15 
 
 
260 aa  102  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187452  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1207  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36 
 
 
238 aa  100  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.646122  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0725  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.58 
 
 
244 aa  99.8  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0816723  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2212  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.5 
 
 
251 aa  99.4  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0314  aspartate/glutamate/uridylate kinase  25.93 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.96916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2375  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.08 
 
 
251 aa  86.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.307477  normal  0.44682 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2605  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.68 
 
 
250 aa  82  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198321  normal  0.303854 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2540  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.14 
 
 
250 aa  82  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1044  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.33 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2137  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.73 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0520229  decreased coverage  0.00000787981 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92808  predicted protein  28.01 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1001  aspartate/glutamate/uridylate kinase  26.94 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.56233  normal  0.37814 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2046  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.86 
 
 
244 aa  67  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.45743  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0440  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.23 
 
 
254 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.2273  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1166  aspartate/glutamate/uridylate kinase  24.58 
 
 
279 aa  60.1  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  37.38 
 
 
367 aa  49.3  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1830  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.62 
 
 
268 aa  49.3  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3036  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  37.38 
 
 
367 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  30.56 
 
 
376 aa  46.2  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0082  gamma-glutamyl kinase  33 
 
 
366 aa  46.2  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  31.75 
 
 
370 aa  46.2  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  30.16 
 
 
369 aa  46.2  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  36.45 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  36.45 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  36.45 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  36.45 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  36.45 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3288  gamma-glutamyl kinase  38.32 
 
 
367 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  36.45 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3301  gamma-glutamyl kinase  38.32 
 
 
367 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000177494  hitchhiker  0.00343208 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4269  gamma-glutamyl kinase  28.45 
 
 
365 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  36.45 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3150  gamma-glutamyl kinase  38.32 
 
 
367 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.384204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  36.45 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  36.45 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  31.13 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  31.13 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  31.13 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  31.13 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  33.94 
 
 
372 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1486  uridylate kinase  29.89 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.891753  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  35.51 
 
 
367 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  35.51 
 
 
367 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  35.51 
 
 
367 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  35.51 
 
 
367 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  35.51 
 
 
367 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  29.69 
 
 
390 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0596  UMP kinase  24.86 
 
 
235 aa  43.1  0.005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2438  uridylate kinase  26.09 
 
 
238 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139798  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4424  gamma-glutamyl kinase  29.25 
 
 
366 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4503  aspartate kinase  33.71 
 
 
418 aa  42.7  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4237  gamma-glutamyl kinase  29.25 
 
 
366 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4284  gamma-glutamyl kinase  29.25 
 
 
366 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3914  gamma-glutamyl kinase  31.65 
 
 
380 aa  42.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  32.65 
 
 
383 aa  42.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  30.19 
 
 
369 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0116  gamma-glutamyl kinase  29.25 
 
 
366 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>