72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0180 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0180  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 
242 aa  483  1e-135  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.255943 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0149  aspartate/glutamate/uridylate kinase  76.89 
 
 
240 aa  376  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1207  aspartate/glutamate/uridylate kinase  70.59 
 
 
238 aa  354  8.999999999999999e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.646122  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0164  aspartate/glutamate/uridylate kinase  69.33 
 
 
238 aa  338  4e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0607  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.78 
 
 
259 aa  132  6e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255147  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1001  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.1 
 
 
255 aa  131  7.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.56233  normal  0.37814 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0725  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.52 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0816723  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0423  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.33 
 
 
264 aa  106  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4059  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.86 
 
 
269 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000196587  normal  0.0625041 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2247  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.58 
 
 
269 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000037352  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0314  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.26 
 
 
247 aa  93.2  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.96916 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0475  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.78 
 
 
248 aa  92.8  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.604856  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1813  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.55 
 
 
254 aa  88.2  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2889  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.84 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00536042  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1420  amino acid kinase  34.2 
 
 
260 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187452  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2396  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.03 
 
 
257 aa  82  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000247206  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0682  helix-turn-helix domain-containing protein  30.63 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2137  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.51 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0520229  decreased coverage  0.00000787981 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1031  aspartate/glutamate/uridylate kinase  26.92 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1166  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.15 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2375  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.02 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.307477  normal  0.44682 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  25.43 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2540  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.29 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0918  aspartate/glutamate/uridylate kinase  25 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.919268  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1763  aspartate/glutamate/uridylate kinase  25.43 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1026  aspartate/glutamate/uridylate kinase  25.43 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0440  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.08 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.2273  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2605  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.96 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198321  normal  0.303854 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2212  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.18 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2285  aspartate/glutamate/uridylate kinase  25.41 
 
 
267 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000652943  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92808  predicted protein  27.8 
 
 
380 aa  57.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1044  aspartate/glutamate/uridylate kinase  25.96 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2046  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.07 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.45743  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1619  gamma-glutamyl kinase  32.73 
 
 
377 aa  53.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18240  glutamate 5-kinase  30.8 
 
 
381 aa  53.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205431  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3216  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.76 
 
 
268 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00631129  normal  0.219894 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1221  glutamate 5-kinase  30.28 
 
 
381 aa  48.9  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000210818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4727  gamma-glutamyl kinase  29.95 
 
 
373 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0759  gamma-glutamyl kinase  34.62 
 
 
393 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2280  glutamate 5-kinase  30.56 
 
 
382 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.000593596 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12658  gamma-glutamyl kinase  25.93 
 
 
263 aa  47  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.325622  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10140  glutamate 5-kinase  37.08 
 
 
401 aa  46.6  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.268625  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3848  gamma-glutamyl kinase  24.82 
 
 
368 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3941  gamma-glutamyl kinase  24.82 
 
 
368 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4056  gamma-glutamyl kinase  24.82 
 
 
368 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0116  gamma-glutamyl kinase  23.24 
 
 
366 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2457  glutamate 5-kinase  37.86 
 
 
374 aa  46.2  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0853623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4284  gamma-glutamyl kinase  22.54 
 
 
366 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2388  gamma-glutamyl kinase  32.79 
 
 
390 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059895  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4237  gamma-glutamyl kinase  22.54 
 
 
366 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4424  gamma-glutamyl kinase  22.54 
 
 
366 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_12867  predicted protein  25.41 
 
 
413 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.047621  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  36.62 
 
 
376 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  34.29 
 
 
385 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0277  acetylglutamate kinase  25.14 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0082  gamma-glutamyl kinase  24.11 
 
 
366 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  40.85 
 
 
378 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2721  gamma-glutamyl kinase  29.27 
 
 
385 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  38.89 
 
 
393 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0251  acetylglutamate kinase  25.14 
 
 
279 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  39.44 
 
 
371 aa  42.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0341  acetylglutamate kinase  31.97 
 
 
305 aa  42.4  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2142  gamma-glutamyl kinase  35.45 
 
 
383 aa  42.4  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000109405 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12530  glutamate 5-kinase  30.17 
 
 
372 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  36.62 
 
 
376 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0224  acetylglutamate kinase  25.14 
 
 
279 aa  42.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  29.61 
 
 
379 aa  42  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3093  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 
377 aa  42  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  39.44 
 
 
376 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0290  gamma-glutamyl kinase  28.03 
 
 
384 aa  42  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000240512  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2867  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 
377 aa  42  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4832  gamma-glutamyl kinase  21.68 
 
 
365 aa  42  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>