48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2889 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2889  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 
256 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00536042  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0682  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 
251 aa  244  6.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2375  aspartate/glutamate/uridylate kinase  53.41 
 
 
251 aa  235  4e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.307477  normal  0.44682 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2212  aspartate/glutamate/uridylate kinase  54.18 
 
 
251 aa  236  4e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1813  aspartate/glutamate/uridylate kinase  52.28 
 
 
254 aa  223  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1420  amino acid kinase  43.19 
 
 
260 aa  178  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187452  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2396  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.74 
 
 
257 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000247206  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0475  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.56 
 
 
248 aa  150  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.604856  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0423  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.64 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2605  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.15 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198321  normal  0.303854 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2540  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.35 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0440  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.51 
 
 
254 aa  118  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.2273  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0607  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.8 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255147  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2046  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.62 
 
 
244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.45743  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0725  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.54 
 
 
244 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0816723  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1830  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.11 
 
 
268 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3036  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0918  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.4 
 
 
257 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.919268  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2247  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.5 
 
 
269 aa  105  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000037352  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1763  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.54 
 
 
257 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1026  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.51 
 
 
257 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2285  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.17 
 
 
267 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000652943  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1031  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.15 
 
 
261 aa  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4059  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.5 
 
 
269 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000196587  normal  0.0625041 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.6 
 
 
257 aa  99.4  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0149  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.79 
 
 
240 aa  88.2  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0180  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.84 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.255943 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0314  aspartate/glutamate/uridylate kinase  25.42 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.96916 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1001  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.06 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.56233  normal  0.37814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3216  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.76 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00631129  normal  0.219894 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1207  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.74 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.646122  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0164  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.28 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1166  aspartate/glutamate/uridylate kinase  25.31 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2137  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.22 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0520229  decreased coverage  0.00000787981 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1044  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92808  predicted protein  31.28 
 
 
380 aa  61.6  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2015  acetylglutamate kinase  27.4 
 
 
295 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000238351  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  24 
 
 
294 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0632  arginine biosynthesis bifunctional protein ArgJ  32.48 
 
 
698 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0325581  normal  0.946734 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  21.72 
 
 
281 aa  46.2  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1101  acetylglutamate kinase  25.2 
 
 
293 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.419485  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  23.14 
 
 
292 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1674  acetylglutamate kinase  24.48 
 
 
301 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  23.67 
 
 
293 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  23.67 
 
 
293 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  28.44 
 
 
295 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  23.23 
 
 
287 aa  42.7  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1081  acetylglutamate kinase  20.18 
 
 
280 aa  42.4  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0152417  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04991  acetylglutamate kinase  21.58 
 
 
300 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>