40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2396 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2396  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 
257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000247206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1420  amino acid kinase  59.84 
 
 
260 aa  308  5e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187452  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0475  aspartate/glutamate/uridylate kinase  47.58 
 
 
248 aa  202  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.604856  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0682  helix-turn-helix domain-containing protein  46.8 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2889  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.74 
 
 
256 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00536042  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1813  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.95 
 
 
254 aa  159  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2212  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.6 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2375  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.13 
 
 
251 aa  153  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.307477  normal  0.44682 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2540  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.08 
 
 
250 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0423  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.65 
 
 
264 aa  132  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0918  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.4 
 
 
257 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.919268  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1763  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.56 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2605  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.3 
 
 
250 aa  126  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198321  normal  0.303854 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1031  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.59 
 
 
261 aa  125  6e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2247  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.91 
 
 
269 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000037352  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0440  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.74 
 
 
254 aa  122  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.2273  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.08 
 
 
257 aa  122  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1026  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.73 
 
 
257 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1830  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.11 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3036  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2046  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.85 
 
 
244 aa  115  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.45743  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2285  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.97 
 
 
267 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000652943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3216  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.77 
 
 
268 aa  109  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00631129  normal  0.219894 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4059  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.41 
 
 
269 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000196587  normal  0.0625041 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0725  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.03 
 
 
244 aa  101  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0816723  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0607  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.19 
 
 
259 aa  99.4  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255147  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0164  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.48 
 
 
238 aa  86.7  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1207  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.62 
 
 
238 aa  85.5  7e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.646122  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0180  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.03 
 
 
242 aa  82  0.000000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.255943 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1044  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.56 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1001  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.09 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.56233  normal  0.37814 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2137  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.13 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0520229  decreased coverage  0.00000787981 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0149  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.33 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0314  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.48 
 
 
247 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.96916 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1166  aspartate/glutamate/uridylate kinase  25 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92808  predicted protein  30.81 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3059  acetylglutamate kinase  23.11 
 
 
333 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  25.18 
 
 
281 aa  47  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1290  acetylglutamate kinase  24.11 
 
 
267 aa  43.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0327535 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0257  acetylglutamate kinase  24.01 
 
 
262 aa  43.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1081  acetylglutamate kinase  23.79 
 
 
280 aa  42.7  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0152417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>