60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2212 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2212  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 
251 aa  496  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1813  aspartate/glutamate/uridylate kinase  57.98 
 
 
254 aa  256  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2375  aspartate/glutamate/uridylate kinase  55.2 
 
 
251 aa  251  6e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.307477  normal  0.44682 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0682  helix-turn-helix domain-containing protein  51.79 
 
 
251 aa  250  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2889  aspartate/glutamate/uridylate kinase  54.18 
 
 
256 aa  246  3e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00536042  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1420  amino acid kinase  44.09 
 
 
260 aa  182  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187452  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0475  aspartate/glutamate/uridylate kinase  45.37 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.604856  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2396  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.7 
 
 
257 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000247206  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2605  aspartate/glutamate/uridylate kinase  44.08 
 
 
250 aa  142  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198321  normal  0.303854 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2540  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.83 
 
 
250 aa  131  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2046  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.56 
 
 
244 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.45743  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0440  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.35 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.2273  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0423  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.5 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0607  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.84 
 
 
259 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255147  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0918  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.76 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.919268  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.08 
 
 
257 aa  109  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1763  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.65 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2247  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.65 
 
 
269 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000037352  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1026  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.65 
 
 
257 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2285  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.2 
 
 
267 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000652943  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1031  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.04 
 
 
261 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0725  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.92 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0816723  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4059  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.33 
 
 
269 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000196587  normal  0.0625041 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1830  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.65 
 
 
268 aa  94  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3036  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1207  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.14 
 
 
238 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.646122  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1166  aspartate/glutamate/uridylate kinase  26.25 
 
 
279 aa  84  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0149  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.14 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0180  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.47 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.255943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3216  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.91 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00631129  normal  0.219894 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0314  aspartate/glutamate/uridylate kinase  25.54 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.96916 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2137  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.87 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0520229  decreased coverage  0.00000787981 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0164  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.22 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92808  predicted protein  31.47 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1001  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.31 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.56233  normal  0.37814 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1044  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.95 
 
 
233 aa  59.7  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0277  acetylglutamate/acetylaminoadipate kinase  26.88 
 
 
261 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0302833  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05571  acetylglutamate kinase  29.29 
 
 
304 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0678457  normal  0.267137 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1832  acetylglutamate kinase  29.29 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.913533  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0372  acetylglutamate/acetylaminoadipate kinase  26.47 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1595  acetylglutamate kinase  25.83 
 
 
258 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05631  acetylglutamate kinase  23.62 
 
 
283 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.231229  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0632  arginine biosynthesis bifunctional protein ArgJ  30.48 
 
 
698 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0325581  normal  0.946734 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04991  acetylglutamate kinase  23.5 
 
 
300 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1040  acetylglutamate kinase  27.35 
 
 
272 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0967  acetylglutamate/acetylaminoadipate kinase  27.12 
 
 
261 aa  47  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120356  hitchhiker  0.00000000299436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4935  acetylglutamate kinase  25.1 
 
 
279 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0350  acetylglutamate kinase  31.32 
 
 
254 aa  45.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201879 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1836  acetylglutamate/acetylaminoadipate kinase  25.74 
 
 
260 aa  45.4  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  22.45 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0738  acetylglutamate kinase  25.54 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0640766  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  25 
 
 
295 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1674  acetylglutamate kinase  26.9 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1162  acetylglutamate kinase  24.27 
 
 
309 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.174929  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1131  acetylglutamate kinase  24.27 
 
 
309 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1257  acetylglutamate kinase  27.41 
 
 
272 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  25.79 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1351  acetylglutamate kinase  23.31 
 
 
283 aa  43.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  24.62 
 
 
299 aa  42.7  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1090  acetylglutamate kinase  23.97 
 
 
245 aa  42.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.171552  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  26.88 
 
 
297 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>