49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0682 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0682  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 
251 aa  498  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1813  aspartate/glutamate/uridylate kinase  55.23 
 
 
254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2889  aspartate/glutamate/uridylate kinase  50 
 
 
256 aa  244  6.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00536042  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2212  aspartate/glutamate/uridylate kinase  51.39 
 
 
251 aa  241  6e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2375  aspartate/glutamate/uridylate kinase  50.2 
 
 
251 aa  241  6e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.307477  normal  0.44682 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2396  aspartate/glutamate/uridylate kinase  46.8 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000247206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1420  amino acid kinase  43.53 
 
 
260 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187452  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0475  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.91 
 
 
248 aa  170  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.604856  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0423  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.18 
 
 
264 aa  136  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2540  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.08 
 
 
250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0607  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.73 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255147  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2046  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.02 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.45743  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2605  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.89 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198321  normal  0.303854 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0440  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.81 
 
 
254 aa  121  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.2273  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0918  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.82 
 
 
257 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.919268  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1763  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.43 
 
 
257 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2247  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.2 
 
 
269 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000037352  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1026  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.43 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1031  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.93 
 
 
261 aa  103  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2285  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30 
 
 
267 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000652943  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1830  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.96 
 
 
268 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3036  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.75 
 
 
257 aa  98.6  9e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4059  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.76 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000196587  normal  0.0625041 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0725  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.46 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0816723  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0314  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.27 
 
 
247 aa  89  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.96916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3216  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.11 
 
 
268 aa  88.6  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00631129  normal  0.219894 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1207  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.11 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.646122  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0180  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.63 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.255943 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2137  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.24 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0520229  decreased coverage  0.00000787981 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1001  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.57 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.56233  normal  0.37814 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92808  predicted protein  31.62 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0149  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.68 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1166  aspartate/glutamate/uridylate kinase  25.19 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0164  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.31 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1044  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.24 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1836  acetylglutamate/acetylaminoadipate kinase  26.48 
 
 
260 aa  53.1  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4429  glutamate 5-kinase  26.15 
 
 
347 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198767  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0372  acetylglutamate/acetylaminoadipate kinase  27.13 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0277  acetylglutamate/acetylaminoadipate kinase  26.48 
 
 
261 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0302833  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1290  acetylglutamate kinase  24.05 
 
 
267 aa  45.4  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0327535 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  25.1 
 
 
293 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  25.1 
 
 
293 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0502  acetylglutamate kinase  25.97 
 
 
245 aa  45.4  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0471681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4240  acetylglutamate kinase  23.91 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0738  acetylglutamate kinase  22.93 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0640766  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0277  acetylglutamate kinase  25.3 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0251  acetylglutamate kinase  25.3 
 
 
279 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0224  acetylglutamate kinase  25.3 
 
 
279 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  24.19 
 
 
292 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>