58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1813 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1813  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 		 254 aa  498  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0682  helix-turn-helix domain-containing protein  54.62 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2212  aspartate/glutamate/uridylate kinase  57.66 
 
 		 251 aa  265  5.999999999999999e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2889  aspartate/glutamate/uridylate kinase  52.59 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00536042  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2375  aspartate/glutamate/uridylate kinase  52.21 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.307477  normal  0.44682 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1420  amino acid kinase  43.97 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187452  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2396  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.53 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000247206  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0475  aspartate/glutamate/uridylate kinase  44.62 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.604856  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2605  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.09 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198321  normal  0.303854 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0607  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.9 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255147  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0423  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.64 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2247  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.7 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000037352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0918  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.33 
 
 		 257 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.919268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2540  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.55 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.33 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1763  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.5 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2046  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.33 
 
 		 244 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.45743  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1026  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.5 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2285  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.99 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000652943  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0440  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.52 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.2273  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1830  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.32 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1207  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.32 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.646122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4059  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.71 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000196587  normal  0.0625041 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1031  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.74 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3216  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.36 
 
 		 268 aa  95.1  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00631129  normal  0.219894 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0149  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.19 
 
 		 240 aa  94.4  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0725  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.59 
 
 		 244 aa  92.8  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0816723  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0180  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.77 
 
 		 242 aa  92  7e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.255943 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2137  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.32 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0520229  decreased coverage  0.00000787981 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0164  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.25 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1001  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.29 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.56233  normal  0.37814 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0314  aspartate/glutamate/uridylate kinase  23.61 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.96916 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1166  aspartate/glutamate/uridylate kinase  24.79 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92808  predicted protein  32.59 
 
 		 380 aa  72.4  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1044  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.91 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1836  acetylglutamate/acetylaminoadipate kinase  27.2 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04991  acetylglutamate kinase  25.77 
 
 		 300 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1595  acetylglutamate kinase  27.34 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  27.55 
 
 		 297 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0277  acetylglutamate/acetylaminoadipate kinase  26.4 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0302833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0738  acetylglutamate kinase  22.93 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0640766  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1162  acetylglutamate kinase  25.82 
 
 		 309 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.174929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1131  acetylglutamate kinase  25.82 
 
 		 309 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0350  acetylglutamate kinase  29 
 
 		 254 aa  45.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000201879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4143  acetylglutamate kinase  27.52 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3361  acetylglutamate kinase  28.99 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.121168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1351  acetylglutamate kinase  24.27 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  26.81 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  24.79 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3095  acetylglutamate kinase  29.6 
 
 		 302 aa  43.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1832  acetylglutamate kinase  28.43 
 
 		 304 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.913533  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05571  acetylglutamate kinase  28.78 
 
 		 304 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0678457  normal  0.267137 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  24.9 
 
 		 299 aa  42.7  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  24.26 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0172  N-acetylglutamate kinase  26.72 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0967  acetylglutamate/acetylaminoadipate kinase  25.57 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120356  hitchhiker  0.00000000299436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0554  acetylglutamate kinase  25.21 
 
 		 297 aa  42  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879034  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0320  acetylglutamate kinase  26.52 
 
 		 264 aa  42  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>