52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2247 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2247  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 		 269 aa  535  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000037352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4059  aspartate/glutamate/uridylate kinase  81.41 
 
 		 269 aa  418  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000196587  normal  0.0625041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3216  aspartate/glutamate/uridylate kinase  61.65 
 
 		 268 aa  291  9e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00631129  normal  0.219894 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2285  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.18 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000652943  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2396  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.91 
 
 		 257 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000247206  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0607  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.51 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255147  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0423  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1813  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.46 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0475  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.96 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.604856  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1031  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.35 
 
 		 261 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.77 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0918  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.4 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.919268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1763  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.3 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0682  helix-turn-helix domain-containing protein  34.2 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1026  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.3 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2889  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.5 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00536042  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2212  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.22 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0180  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.58 
 
 		 242 aa  101  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.255943 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0164  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.8 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0149  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.4 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1420  amino acid kinase  31.58 
 
 		 260 aa  99.4  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187452  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0314  aspartate/glutamate/uridylate kinase  26.1 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.96916 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0725  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.74 
 
 		 244 aa  95.1  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0816723  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1207  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.19 
 
 		 238 aa  92.8  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.646122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2375  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.47 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.307477  normal  0.44682 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2540  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.42 
 
 		 250 aa  90.1  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2605  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.72 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198321  normal  0.303854 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0440  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.61 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.2273  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1044  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.08 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1001  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.46 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.56233  normal  0.37814 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2137  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.13 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0520229  decreased coverage  0.00000787981 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92808  predicted protein  30.7 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2046  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.4 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.45743  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1166  aspartate/glutamate/uridylate kinase  22.18 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  34.01 
 
 		 383 aa  52.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  31.48 
 
 		 376 aa  47  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1830  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.66 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  28.99 
 
 		 390 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0596  UMP kinase  24.88 
 
 		 235 aa  45.8  0.0007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  32.65 
 
 		 377 aa  45.8  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2085  uridylate kinase  20.83 
 
 		 231 aa  45.4  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00820156  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  38.1 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  25.81 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  27.88 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  31.43 
 
 		 370 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00343  gamma-glutamyl kinase  37.93 
 
 		 384 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000428896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  30.16 
 
 		 369 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  24.71 
 
 		 241 aa  43.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  32.38 
 
 		 363 aa  42.7  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0082  gamma-glutamyl kinase  32.88 
 
 		 366 aa  42.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1116  aspartate kinase  22.64 
 
 		 404 aa  42  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000216352  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  25.96 
 
 		 244 aa  42  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>