44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2375 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2375  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 		 251 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.307477  normal  0.44682 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2212  aspartate/glutamate/uridylate kinase  54.8 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0682  helix-turn-helix domain-containing protein  50.2 
 
 		 251 aa  241  6e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2889  aspartate/glutamate/uridylate kinase  53.41 
 
 		 256 aa  235  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00536042  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1813  aspartate/glutamate/uridylate kinase  52.72 
 
 		 254 aa  211  7e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1420  amino acid kinase  40.4 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187452  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2396  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.13 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000247206  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0475  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.17 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.604856  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2605  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.78 
 
 		 250 aa  131  9e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198321  normal  0.303854 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2540  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.03 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0423  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.64 
 
 		 264 aa  120  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2046  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.36 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.45743  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0918  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.47 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.919268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0607  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.57 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255147  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1763  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.77 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0440  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.46 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.2273  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1026  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.17 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1830  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.55 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.92 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2285  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.45 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000652943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2247  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.47 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000037352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1001  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.94 
 
 		 255 aa  85.5  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.56233  normal  0.37814 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0725  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.35 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0816723  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1031  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.05 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4059  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.29 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000196587  normal  0.0625041 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1207  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.84 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.646122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0149  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.44 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0314  aspartate/glutamate/uridylate kinase  24.8 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.96916 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0164  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.09 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1166  aspartate/glutamate/uridylate kinase  26.81 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0180  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.02 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.255943 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2137  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.99 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0520229  decreased coverage  0.00000787981 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3216  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.13 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00631129  normal  0.219894 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  27.41 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92808  predicted protein  28.76 
 
 		 380 aa  58.9  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  27.04 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  27.04 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1326  acetylglutamate kinase  25.94 
 
 		 301 aa  46.6  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1040  acetylglutamate kinase  27.76 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1068  N-acetylglutamate kinase  28.1 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.179639  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0632  arginine biosynthesis bifunctional protein ArgJ  30.28 
 
 		 698 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0325581  normal  0.946734 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1101  acetylglutamate kinase  26.14 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.419485  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0738  acetylglutamate kinase  25.21 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0640766  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0324  acetylglutamate kinase  28.16 
 
 		 287 aa  42  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.491958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>