38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3216 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3216  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 
268 aa  527  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00631129  normal  0.219894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2247  aspartate/glutamate/uridylate kinase  61.65 
 
 
269 aa  315  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000037352  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4059  aspartate/glutamate/uridylate kinase  60.15 
 
 
269 aa  299  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000196587  normal  0.0625041 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2285  aspartate/glutamate/uridylate kinase  46.21 
 
 
267 aa  212  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000652943  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2396  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.77 
 
 
257 aa  116  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000247206  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0607  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.68 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255147  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1813  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.94 
 
 
254 aa  102  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0475  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.01 
 
 
248 aa  100  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.604856  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1763  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.39 
 
 
257 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0918  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.1 
 
 
257 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.919268  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.87 
 
 
257 aa  100  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0682  helix-turn-helix domain-containing protein  30.11 
 
 
251 aa  99.8  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1026  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.87 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0725  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.9 
 
 
244 aa  96.7  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0816723  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1031  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.32 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1420  amino acid kinase  31.33 
 
 
260 aa  92.8  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187452  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2889  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.76 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00536042  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0423  aspartate/glutamate/uridylate kinase  26.25 
 
 
264 aa  89.4  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0164  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.53 
 
 
238 aa  85.9  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2212  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.91 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2540  aspartate/glutamate/uridylate kinase  35.93 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1207  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.48 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.646122  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0314  aspartate/glutamate/uridylate kinase  25.88 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.96916 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0149  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.77 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0180  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.33 
 
 
242 aa  72  0.000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.255943 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2375  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.13 
 
 
251 aa  72  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.307477  normal  0.44682 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92808  predicted protein  29.29 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2605  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.47 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198321  normal  0.303854 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1044  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.25 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0440  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.77 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.2273  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2046  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.59 
 
 
244 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.45743  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2137  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.45 
 
 
224 aa  52.8  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0520229  decreased coverage  0.00000787981 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1001  aspartate/glutamate/uridylate kinase  26.6 
 
 
255 aa  50.4  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.56233  normal  0.37814 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  39.51 
 
 
383 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1830  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.05 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3036  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  50 
 
 
377 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  47.27 
 
 
377 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1166  aspartate/glutamate/uridylate kinase  24.27 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>