37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1166 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1166  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 		 279 aa  573  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0423  aspartate/glutamate/uridylate kinase  29.02 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0475  aspartate/glutamate/uridylate kinase  26.95 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.604856  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0149  aspartate/glutamate/uridylate kinase  25.75 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2889  aspartate/glutamate/uridylate kinase  25.31 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00536042  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1420  amino acid kinase  25.88 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187452  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0164  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.78 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0314  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.51 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.96916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2212  aspartate/glutamate/uridylate kinase  26.94 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0180  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.15 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.255943 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2375  aspartate/glutamate/uridylate kinase  26.81 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.307477  normal  0.44682 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0725  aspartate/glutamate/uridylate kinase  25.74 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0816723  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1207  aspartate/glutamate/uridylate kinase  26.5 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.646122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0682  helix-turn-helix domain-containing protein  25.19 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1001  aspartate/glutamate/uridylate kinase  26.21 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.56233  normal  0.37814 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1813  aspartate/glutamate/uridylate kinase  24.77 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1031  aspartate/glutamate/uridylate kinase  23.11 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  26.01 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2396  aspartate/glutamate/uridylate kinase  25 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000247206  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1763  aspartate/glutamate/uridylate kinase  25.27 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0607  aspartate/glutamate/uridylate kinase  23.91 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255147  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0918  aspartate/glutamate/uridylate kinase  24.18 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.919268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2540  aspartate/glutamate/uridylate kinase  23.6 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1026  aspartate/glutamate/uridylate kinase  24.54 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2605  aspartate/glutamate/uridylate kinase  24.78 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198321  normal  0.303854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2285  aspartate/glutamate/uridylate kinase  22.46 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000652943  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4059  aspartate/glutamate/uridylate kinase  24.17 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000196587  normal  0.0625041 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2247  aspartate/glutamate/uridylate kinase  22.18 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000037352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2046  aspartate/glutamate/uridylate kinase  24.89 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.45743  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0440  aspartate/glutamate/uridylate kinase  22.69 
 
 		 254 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.2273  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11430  glutamate 5-kinase  24 
 
 		 419 aa  45.8  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015936 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  24.74 
 
 		 366 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1467  gamma-glutamyl kinase  23.4 
 
 		 368 aa  43.1  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.148048  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  21.58 
 
 		 393 aa  42.7  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1830  aspartate/glutamate/uridylate kinase  24.24 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  22.69 
 
 		 374 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1575  gamma-glutamyl kinase  24 
 
 		 363 aa  42.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>