30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2178 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2178  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 		 204 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1843  aspartate/glutamate/uridylate kinase  93.14 
 
 		 204 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1794  aspartate/glutamate/uridylate kinase  73.06 
 
 		 213 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.453812  normal  0.620539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5016  aspartate/glutamate/uridylate kinase  60.56 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.761647  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2724  aspartate/glutamate/uridylate kinase  55.38 
 
 		 191 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5320  aspartate/glutamate/uridylate kinase  58.56 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4102  amino acid kinase family protein  46.15 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0254  amino acid kinase family protein  40.12 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2395  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.81 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1647  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.46 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000510531  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2871  amino acid kinase family protein  46.75 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2457  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein, putative kinase  37.7 
 
 		 196 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330903  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6500  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.7 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0428834 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5938  tetrahydromethanopterin biosynthesis protein, putative kinase  39.16 
 
 		 196 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259403  normal  0.0234178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2619  uncharacterized kinase  36.67 
 
 		 202 aa  89.4  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0138067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3140  aspartate/glutamate/uridylate kinase  36.31 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3438  1-pyrroline-5-carboxylate synthetase  31.55 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0400881 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0628  hypothetical protein  33.12 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0494  aspartate/glutamate/uridylate kinase  33.77 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.104151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1317  aspartate/glutamate/uridylate kinase  30.91 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1274  aspartate/glutamate/uridylate kinase  28.06 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000302889  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0644  aspartate/glutamate/uridylate kinase  26.15 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0413219  hitchhiker  0.000314302 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2346  1-pyrroline-5-carboxylate synthetase  26.42 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2332  Uncharacterized aspartokinase uridylate kinase-like protein  28.8 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.428071  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.97 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal  0.701682 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0710  aspartate/glutamate/uridylate kinase  26.15 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.155359  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0179  aspartate/glutamate/uridylate kinase  26.15 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000583538  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2447  aspartate/glutamate/uridylate kinase  31.98 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.952471  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3071  aspartokinase uridylate kinase-like putative kinase  40.62 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1384  aspartate/glutamate/uridylate kinase  27.61 
 
 		 220 aa  49.3  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>