33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2688 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2688  HTR-like protein  100 
 
 		 297 aa  608  1e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2356  HTR-like protein  54.28 
 
 		 275 aa  301  7.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0927177  normal  0.984373 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1171  HTR-like protein  53.31 
 
 		 288 aa  295  7e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0316318  normal  0.546132 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0554  HTR-like protein  37.13 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2108  hypothetical protein  33.81 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1349  HTR-like protein  32.26 
 
 		 279 aa  172  5.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0330184 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2362  HTR-like protein  31.29 
 
 		 296 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.034211  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2039  hypothetical protein  32.01 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0780  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit D-like protein  35.97 
 
 		 286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.1281  unclonable  0.000000000000178249 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2996  HTR-like protein  22.18 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  27.44 
 
 		 504 aa  53.5  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  25.6 
 
 		 510 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  25.2 
 
 		 510 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  22.18 
 
 		 254 aa  47  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  26.8 
 
 		 570 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  24.08 
 
 		 562 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  29.35 
 
 		 565 aa  46.2  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  24.58 
 
 		 504 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0927  DNA repair protein RadA  41.18 
 
 		 482 aa  45.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  41.18 
 
 		 481 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4341  circadian clock protein KaiC  30.39 
 
 		 574 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213757  hitchhiker  0.00291063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  25.91 
 
 		 584 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  26.97 
 
 		 514 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  40.43 
 
 		 482 aa  43.9  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  25.3 
 
 		 570 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  35.09 
 
 		 250 aa  43.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0449  DNA repair protein RadA  44.44 
 
 		 460 aa  42.7  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0204936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0546  DNA repair protein RadA  44.44 
 
 		 460 aa  42.7  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3470  DNA repair protein RadA  36.36 
 
 		 461 aa  42.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.49 
 
 		 503 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2542  circadian clock protein KaiC  25.29 
 
 		 560 aa  42.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0135  DNA repair protein RadA  40.82 
 
 		 449 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  47.37 
 
 		 224 aa  42.4  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>