17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2356 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2356  HTR-like protein  100 
 
 		 275 aa  561  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0927177  normal  0.984373 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2688  HTR-like protein  54.28 
 
 		 297 aa  301  6.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1171  HTR-like protein  49.45 
 
 		 288 aa  263  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0316318  normal  0.546132 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2108  hypothetical protein  35.25 
 
 		 278 aa  162  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2362  HTR-like protein  31.41 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.034211  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0554  HTR-like protein  34.56 
 
 		 272 aa  152  8e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2039  hypothetical protein  31.41 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1349  HTR-like protein  29.5 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0330184 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0780  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit D-like protein  34.51 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.1281  unclonable  0.000000000000178249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1685  DNA repair protein RadA  36.59 
 
 		 466 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  36 
 
 		 565 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  24.08 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  27.24 
 
 		 504 aa  42.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  34.62 
 
 		 510 aa  42.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  33.33 
 
 		 227 aa  42.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  34.62 
 
 		 510 aa  42  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  29.7 
 
 		 324 aa  42  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>