31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0554 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0554  HTR-like protein  100 
 
 		 272 aa  546  1e-154  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2688  HTR-like protein  37.13 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1171  HTR-like protein  35.51 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0316318  normal  0.546132 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2108  hypothetical protein  35.36 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2356  HTR-like protein  34.56 
 
 		 275 aa  152  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0927177  normal  0.984373 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2362  HTR-like protein  32.73 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.034211  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2039  hypothetical protein  32.49 
 
 		 278 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1349  HTR-like protein  31.54 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0330184 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0780  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit D-like protein  30.18 
 
 		 286 aa  116  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.1281  unclonable  0.000000000000178249 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2996  HTR-like protein  23.28 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  28.68 
 
 		 455 aa  50.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  33.75 
 
 		 453 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  52.63 
 
 		 235 aa  45.8  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  29.63 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  46.51 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  45.95 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  23.71 
 
 		 517 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  44.74 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2890  KaiA binding protein  40.43 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  25.71 
 
 		 461 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  44.74 
 
 		 565 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  26.97 
 
 		 496 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  40 
 
 		 482 aa  43.5  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01521  DNA repair protein RadA  40.82 
 
 		 450 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.268386  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  29.35 
 
 		 457 aa  42.7  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  28.95 
 
 		 457 aa  42.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  35.94 
 
 		 495 aa  42.4  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  42.22 
 
 		 452 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  36.67 
 
 		 510 aa  42.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01501  DNA repair protein RadA  46.34 
 
 		 450 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.309187  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0135  DNA repair protein RadA  46.34 
 
 		 449 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>