15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2108 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2108  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  548  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1349  HTR-like protein  56.27 
 
 		 279 aa  321  9.000000000000001e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0330184 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2362  HTR-like protein  53.6 
 
 		 296 aa  319  1.9999999999999998e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.034211  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2039  hypothetical protein  55.4 
 
 		 278 aa  317  2e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2688  HTR-like protein  33.81 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2356  HTR-like protein  35.25 
 
 		 275 aa  162  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0927177  normal  0.984373 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0554  HTR-like protein  35.36 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1171  HTR-like protein  31.67 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0316318  normal  0.546132 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0780  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit D-like protein  29.01 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.1281  unclonable  0.000000000000178249 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2996  HTR-like protein  25.75 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  38.24 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  45.65 
 
 		 457 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0927  DNA repair protein RadA  48.15 
 
 		 482 aa  43.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  48.15 
 
 		 481 aa  43.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  62.5 
 
 		 482 aa  42.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>