14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0780 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0780  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit D-like protein  100 
 
 		 286 aa  590  1e-168  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.1281  unclonable  0.000000000000178249 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2688  HTR-like protein  35.97 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1171  HTR-like protein  34.15 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0316318  normal  0.546132 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2356  HTR-like protein  34.51 
 
 		 275 aa  136  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0927177  normal  0.984373 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2108  hypothetical protein  29.01 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0554  HTR-like protein  30.18 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1349  HTR-like protein  27.65 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0330184 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2362  HTR-like protein  27.18 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.034211  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2039  hypothetical protein  26.03 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  47.92 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  24.19 
 
 		 494 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2996  HTR-like protein  25.45 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  38.89 
 
 		 517 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1747  DNA repair protein RadA  35.38 
 
 		 512 aa  42.7  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>