19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2362 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2362  HTR-like protein  100 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.034211  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1349  HTR-like protein  62.72 
 
 
279 aa  369  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0330184 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2039  hypothetical protein  56.47 
 
 
278 aa  330  1e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2108  hypothetical protein  53.6 
 
 
278 aa  319  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2688  HTR-like protein  31.29 
 
 
297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2356  HTR-like protein  31.41 
 
 
275 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0927177  normal  0.984373 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0554  HTR-like protein  32.73 
 
 
272 aa  149  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1171  HTR-like protein  28.52 
 
 
288 aa  136  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0316318  normal  0.546132 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0780  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit D-like protein  27.18 
 
 
286 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.1281  unclonable  0.000000000000178249 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2996  HTR-like protein  29.13 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691032  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  37.5 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  39.29 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  30.91 
 
 
514 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  40 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  32.56 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  33.71 
 
 
258 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  35.38 
 
 
497 aa  42.7  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0010  putative circadian clock protein, KaiC  30.77 
 
 
257 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  30 
 
 
364 aa  42.4  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>