13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2039 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2039  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  559  1e-158  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2362  HTR-like protein  56.47 
 
 		 296 aa  330  1e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.034211  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2108  hypothetical protein  55.4 
 
 		 278 aa  317  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1349  HTR-like protein  55.2 
 
 		 279 aa  310  1e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0330184 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2688  HTR-like protein  32.01 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2356  HTR-like protein  31.41 
 
 		 275 aa  146  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0927177  normal  0.984373 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0554  HTR-like protein  32.49 
 
 		 272 aa  145  8.000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1171  HTR-like protein  29.5 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0316318  normal  0.546132 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0780  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit D-like protein  26.03 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.1281  unclonable  0.000000000000178249 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2996  HTR-like protein  26.42 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  56.1 
 
 		 457 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  20.77 
 
 		 254 aa  42.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4269  DNA repair protein RadA  48.08 
 
 		 481 aa  42  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>