24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1171 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1171  HTR-like protein  100 
 
 		 288 aa  590  1e-168  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0316318  normal  0.546132 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2688  HTR-like protein  53.31 
 
 		 297 aa  295  6e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2356  HTR-like protein  49.45 
 
 		 275 aa  263  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0927177  normal  0.984373 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0554  HTR-like protein  35.51 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0780  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase subunit D-like protein  34.15 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.1281  unclonable  0.000000000000178249 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2108  hypothetical protein  31.67 
 
 		 278 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1349  HTR-like protein  30.5 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0330184 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2039  hypothetical protein  29.5 
 
 		 278 aa  139  6e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2362  HTR-like protein  28.52 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.034211  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2996  HTR-like protein  25 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  26.83 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  26.03 
 
 		 262 aa  47  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  26.67 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  35.51 
 
 		 224 aa  46.2  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  31.52 
 
 		 455 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2630  DNA repair protein RadA  53.49 
 
 		 470 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.540448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2228  putative circadian clock protein, KaiC  31.65 
 
 		 484 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  24.12 
 
 		 475 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0219  putative circadian clock protein, KaiC  41.3 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  36.36 
 
 		 454 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  23.48 
 
 		 457 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01521  DNA repair protein RadA  26.41 
 
 		 450 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.268386  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1328  putative circadian clock protein, KaiC  43.48 
 
 		 271 aa  42.4  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0406  DNA repair protein RadA  44.19 
 
 		 454 aa  42.4  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.509389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>