110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6641 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  100 
 
 		 95 aa  187  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  43.68 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  39.36 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  38.3 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  37.23 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  38.3 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  34.41 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  32.29 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  40.43 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  32.98 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  32.98 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  32.98 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  33.33 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5218  hypothetical protein  36.17 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  35.48 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  36.56 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  33.68 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  35.11 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  34.04 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  34.78 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  31.91 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  34.74 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  37.89 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  32.98 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  30.53 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  32.26 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1452  hypothetical protein  30.53 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  34.38 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  31.18 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  34.04 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  29.03 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  30.11 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1504  hypothetical protein  30.85 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  28.42 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  30.43 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  31.91 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  36.96 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  36.84 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  29.47 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0724  hypothetical protein  29.63 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  30.85 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  30.85 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  29.47 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  33.7 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  37.1 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2309  hypothetical protein  25.27 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  29.47 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  27.37 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1128  hypothetical protein  31.18 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  32.53 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  29.47 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3978  glucose inhibited division protein  29.79 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.174401 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  30.43 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  28.26 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  32.61 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  31.91 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  27.37 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  31.91 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  31.52 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  29.35 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3894  hypothetical protein  27.96 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  27.66 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0461  hypothetical protein  27.08 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  30.77 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0358  hypothetical protein  29.89 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  29.47 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  23.08 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11761  hypothetical protein  27.08 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0410436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  30.77 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  29.47 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1937  hypothetical protein  31.91 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0325431 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  34.41 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12241  hypothetical protein  29.49 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1988  hypothetical protein  31.08 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  32.26 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03931  hypothetical protein  23.33 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.719494  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  38.1 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0310  hypothetical protein  22.78 
 
 		 97 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0338  hypothetical protein  26.6 
 
 		 98 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  26.6 
 
 		 112 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1874  hypothetical protein  26.6 
 
 		 98 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1789  hypothetical protein  26.6 
 
 		 98 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35863  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06361  hypothetical protein  21.51 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.481092 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4093  hypothetical protein  46.94 
 
 		 97 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5111  hypothetical protein  29.11 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4047  hypothetical protein  28.74 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7205  protein of unknown function DUF1330  33.78 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1498  hypothetical protein  21.11 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2846  hypothetical protein  34.41 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  31.52 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  30.12 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  39.68 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  30.43 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  25 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4004  protein of unknown function DUF1330  30.12 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  28.57 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  29.03 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11881  hypothetical protein  22.47 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>