24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2846 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2846  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  210  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  35.11 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  31.91 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  32.26 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  31.18 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  30.11 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  30.11 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  31.87 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  32.98 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  30.43 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  26.53 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  37.63 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  36.56 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1128  hypothetical protein  36.56 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  32.61 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  38 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0727  hypothetical protein  30.53 
 
 		 98 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0823  hypothetical protein  32.53 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.636113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  34.41 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  30.85 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  31.87 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  31.91 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>