70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4211 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  100 
 
 		 95 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  78.95 
 
 		 95 aa  157  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  78.95 
 
 		 95 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  78.95 
 
 		 95 aa  156  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  78.95 
 
 		 95 aa  156  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0668  protein of unknown function DUF1330  71.28 
 
 		 95 aa  141  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0495537  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7719  hypothetical protein  77.11 
 
 		 84 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0105  hypothetical protein  55.79 
 
 		 110 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.771179 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3966  protein of unknown function DUF1330  54.74 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0727  hypothetical protein  44.21 
 
 		 98 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3241  protein of unknown function DUF1330  43.16 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  43.42 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  35.42 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  36.14 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  36.14 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  36.14 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  32.29 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  37.76 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  36.73 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  36.56 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  32.29 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  33.68 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  32.29 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1504  hypothetical protein  30.3 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  34.78 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  28.42 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  31.52 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4630  protein of unknown function DUF1330  43.4 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  49.09 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  27.37 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  31.25 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  42.65 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  35.29 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  31.25 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1901  hypothetical protein  30.53 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00121592  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  29.47 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  29.47 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  41.54 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  44.23 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  33.7 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  34.67 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  34.94 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  33.7 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  35.85 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  32.63 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  40.58 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  29.29 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  34.33 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  44.07 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2846  hypothetical protein  38 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  29.17 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  30.77 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0724  hypothetical protein  36.71 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12241  hypothetical protein  34.62 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  27.91 
 
 		 96 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  34.33 
 
 		 106 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  34.21 
 
 		 96 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  31.91 
 
 		 96 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  30 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0358  hypothetical protein  34.15 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  35.85 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1988  hypothetical protein  33.73 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5042  hypothetical protein  27.71 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.662041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  34.33 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  28.12 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  35.53 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  29.17 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3354  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10898  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  38.24 
 
 		 95 aa  40  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  34.09 
 
 		 101 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>