38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3966 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3966  protein of unknown function DUF1330  100 
 
 		 95 aa  197  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0668  protein of unknown function DUF1330  59.57 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0495537  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  57.89 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  54.74 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0105  hypothetical protein  54.74 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.771179 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  53.68 
 
 		 95 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  53.68 
 
 		 95 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  53.68 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0727  hypothetical protein  47.37 
 
 		 98 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7719  hypothetical protein  56.1 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3241  protein of unknown function DUF1330  42.11 
 
 		 98 aa  87  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  32.29 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  35.63 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  34.74 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  34.74 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  37.8 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  32.26 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1937  hypothetical protein  32.53 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0325431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  33.33 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  32.5 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  31.33 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  34.15 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1901  hypothetical protein  31.25 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00121592  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  30.12 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  28.42 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  34.04 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  32.29 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  34.52 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  32.93 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  35.23 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  34.52 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  31.71 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  32.93 
 
 		 96 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  34.15 
 
 		 95 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2371  hypothetical protein  34.52 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.762767  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  32.56 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  30.49 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  31.25 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>