110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1076 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  205  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  37.76 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3978  glucose inhibited division protein  41.05 
 
 		 96 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.174401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  40.43 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  37.63 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  34.04 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  34.04 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  35.37 
 
 		 102 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  34.83 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  37.11 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4047  hypothetical protein  30.85 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1641  hypothetical protein  32.65 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825876  hitchhiker  0.000000345307 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  34.88 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  34.04 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  32.98 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  30.21 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  32.29 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3894  hypothetical protein  36.62 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  31.87 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1754  hypothetical protein  35.16 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  32.29 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  34.38 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  34.44 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0823  hypothetical protein  36.47 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.636113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  40.51 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  32.61 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  31.91 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  32.98 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  32.26 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  37.97 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  33.7 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0338  hypothetical protein  32.98 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418889  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  32.32 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  31.18 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1874  hypothetical protein  32.98 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1789  hypothetical protein  32.98 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35863  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  32.63 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  32.29 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0958  hypothetical protein  32.98 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0421  hypothetical protein  32.98 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0223  hypothetical protein  32.98 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0195535  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1378  hypothetical protein  32.98 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  28.87 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  30.85 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5111  hypothetical protein  36.05 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  31.52 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  28.42 
 
 		 96 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  30.85 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  28.57 
 
 		 95 aa  48.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  30.85 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  30.43 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  33.68 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  27.96 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  35.29 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0310  hypothetical protein  31.58 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  31.96 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1504  hypothetical protein  29.17 
 
 		 127 aa  47.4  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  33.68 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  30.11 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  31.58 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  30.85 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1937  hypothetical protein  34.04 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0325431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0668  protein of unknown function DUF1330  33.77 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0495537  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  28.57 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  29.67 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  31.58 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  28.42 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  29.03 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3966  protein of unknown function DUF1330  32.5 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  30.11 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  31.96 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  30.11 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  30.11 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  32.63 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  27.66 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  30.85 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  30.85 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  27.66 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  27.55 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  31.58 
 
 		 106 aa  43.9  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0461  hypothetical protein  30.11 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0458  hypothetical protein  32.26 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42868  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  31.18 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  28.87 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  29.47 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1128  hypothetical protein  29.67 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  31.17 
 
 		 89 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7719  hypothetical protein  31.17 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0434  hypothetical protein  31.18 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11761  hypothetical protein  30.11 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0410436 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2371  hypothetical protein  30.53 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.762767  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3118  protein of unknown function DUF1330  30.77 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  25.53 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10898  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  26.26 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1519  protein of unknown function DUF1330  36.51 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.407227 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  28.87 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1521  hypothetical protein  36.51 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.997326  normal  0.585973 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  27.84 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>