59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0105 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0105  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  225  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.771179 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  55.79 
 
 		 95 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  55.79 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  54.74 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  54.74 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  54.74 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3966  protein of unknown function DUF1330  54.74 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0668  protein of unknown function DUF1330  56.38 
 
 		 95 aa  104  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0495537  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7719  hypothetical protein  54.88 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0727  hypothetical protein  46.32 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3241  protein of unknown function DUF1330  44.21 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  39.33 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  38.2 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  37.08 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  35.44 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  36.05 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  35.42 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  33.67 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  37.08 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  37.08 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  35.29 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  32.93 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2371  hypothetical protein  37.8 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.762767  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  36.59 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  36.59 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  39.44 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  35.29 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  35.71 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  36.11 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  34.09 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  32.29 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1937  hypothetical protein  33.72 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0325431 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12241  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0724  hypothetical protein  44.3 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4630  protein of unknown function DUF1330  31.65 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  33.72 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  33.72 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  32.56 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  34.88 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3777  hypothetical protein  40.21 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  44.64 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  31.11 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  31.58 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  32.99 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  30 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3704  hypothetical protein  40.21 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1901  hypothetical protein  29.47 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00121592  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  32.56 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  32.94 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  30.21 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  34.67 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1641  hypothetical protein  32.14 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825876  hitchhiker  0.000000345307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3717  hypothetical protein  39.18 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  31.82 
 
 		 114 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  27.59 
 
 		 94 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  31.4 
 
 		 97 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>