52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0939 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  190  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  45.05 
 
 
92 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  38.64 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  37.5 
 
 
95 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5111  hypothetical protein  28.57 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  36.78 
 
 
106 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  42.42 
 
 
107 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4630  protein of unknown function DUF1330  36.59 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  39.53 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  32.53 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  32.93 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  35.38 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0823  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.636113  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  31.33 
 
 
106 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  32.53 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  39.71 
 
 
112 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  31.33 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  34.52 
 
 
106 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  30.85 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  32.47 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  34.83 
 
 
98 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  34.09 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  31.52 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  31.58 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  34.57 
 
 
110 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3978  glucose inhibited division protein  33.7 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.174401 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1901  hypothetical protein  33.73 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00121592  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  29.35 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  30 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  28.26 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  33.8 
 
 
96 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  29.35 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  30.43 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  31.58 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7205  protein of unknown function DUF1330  30.38 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  30.43 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  30.43 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  29.27 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1988  hypothetical protein  31.88 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332704  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  30.77 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  29.41 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  31.87 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0105  hypothetical protein  30 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.771179 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  31.87 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  31.87 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  32.93 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0603  protein of unknown function DUF1330  28.57 
 
 
96 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  29.76 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  29.27 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  30.12 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4004  protein of unknown function DUF1330  31.34 
 
 
157 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  30.26 
 
 
98 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.738458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>