78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4583 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  229  9e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  66.98 
 
 		 106 aa  143  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  64.15 
 
 		 107 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  63.81 
 
 		 106 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  62.86 
 
 		 106 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  61.9 
 
 		 106 aa  130  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  61.9 
 
 		 106 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  61.9 
 
 		 106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  60.95 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  58.88 
 
 		 112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  64.37 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1901  hypothetical protein  55.24 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00121592  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  49 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4630  protein of unknown function DUF1330  48.51 
 
 		 109 aa  106  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3354  hypothetical protein  61.64 
 
 		 73 aa  92.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10898  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  44.44 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0823  hypothetical protein  42.35 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.636113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  42.53 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  36.05 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  35.35 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  35.14 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  32.63 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  37.33 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  35.71 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  40.85 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  32.99 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  32.99 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  30.53 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  30.53 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  39.53 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  30.53 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  37.88 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  38.67 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0434  hypothetical protein  37.88 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  32.89 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  32.89 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  32.32 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  39.19 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  35.9 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  30.68 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  37.1 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  35.29 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7719  hypothetical protein  32 
 
 		 84 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0668  protein of unknown function DUF1330  28.72 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0495537  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  30.21 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  28.42 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1641  hypothetical protein  29.9 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825876  hitchhiker  0.000000345307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0358  hypothetical protein  44.62 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  30.53 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  32 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0358  hypothetical protein  37.04 
 
 		 214 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0495198  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  31.08 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  35.14 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  30.67 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  35.94 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  31.96 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  31.96 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  31.96 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  31.18 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  27.03 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  31.08 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  33.78 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  34.38 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  40.74 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  34.38 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  28.57 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  35 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5042  hypothetical protein  32 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.662041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  32.63 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3978  glucose inhibited division protein  31.71 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.174401 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  28.42 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2309  hypothetical protein  27.5 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  36.67 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  28.87 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  36.67 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  29.33 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  30.53 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>