58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0734 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  207  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  207  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  207  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0358  hypothetical protein  56.18 
 
 
104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  51.04 
 
 
96 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1452  hypothetical protein  52.75 
 
 
96 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  32.98 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5218  hypothetical protein  29.47 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  33.71 
 
 
98 aa  57.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0724  hypothetical protein  37.8 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  30.93 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  36.14 
 
 
95 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  26.32 
 
 
95 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  31.25 
 
 
97 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  32.14 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0040  protein of unknown function DUF1330  39.13 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000083486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  33.72 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  25.53 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  27.66 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  33.67 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  26.09 
 
 
96 aa  48.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  34.18 
 
 
102 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1789  hypothetical protein  28.42 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35863  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1874  hypothetical protein  28.42 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446386  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0338  hypothetical protein  28.42 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418889  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0223  hypothetical protein  30.61 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0195535  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0421  hypothetical protein  30.61 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0958  hypothetical protein  30.61 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1378  hypothetical protein  30.61 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  31.52 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  23.91 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  31.96 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4047  hypothetical protein  26.88 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12241  hypothetical protein  28.75 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  30.11 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  33.67 
 
 
106 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  33.67 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7719  hypothetical protein  31.33 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  33.67 
 
 
106 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2621  hypothetical protein  30.23 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.249964  normal  0.209619 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  32.29 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0668  protein of unknown function DUF1330  34.15 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0495537  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  24.47 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  32 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  28.57 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  27.17 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3241  protein of unknown function DUF1330  28.24 
 
 
98 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386279  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  29.47 
 
 
110 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  32.53 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  28.57 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  31.52 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1905  hypothetical protein  27.17 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682108  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  34 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  26.6 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  29.9 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  23.4 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  32.65 
 
 
133 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  30.12 
 
 
95 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>