27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4047 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4047  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  221  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3894  hypothetical protein  35.23 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3978  glucose inhibited division protein  32.63 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.174401 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  30.85 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  35.37 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  30.26 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  31.18 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  31.17 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  32.26 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  33.72 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  32.93 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  30.77 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0310  hypothetical protein  32.29 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  28.71 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  26.88 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  32.26 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  26.88 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  26.88 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  28.74 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  27.37 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  25.27 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1789  hypothetical protein  24.73 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35863  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1874  hypothetical protein  24.73 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446386  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0338  hypothetical protein  24.73 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418889  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  31.58 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  23.91 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  26 
 
 		 104 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>