62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2715 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  94.34 
 
 
106 aa  201  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  92.45 
 
 
106 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  91.51 
 
 
106 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  90.57 
 
 
133 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  84.91 
 
 
106 aa  183  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  78.3 
 
 
106 aa  174  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  62.86 
 
 
107 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  63.81 
 
 
115 aa  133  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  56.31 
 
 
112 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1901  hypothetical protein  50.48 
 
 
106 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00121592  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  50.54 
 
 
112 aa  102  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  55.17 
 
 
89 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4630  protein of unknown function DUF1330  46.53 
 
 
109 aa  99.4  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3354  hypothetical protein  61.64 
 
 
73 aa  91.3  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10898  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  31.63 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  36.9 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  37.5 
 
 
97 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  32.63 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  37.78 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  45.1 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  29.47 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  32.53 
 
 
91 aa  50.4  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  33.67 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  38.33 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  29.47 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  30.61 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  30.61 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  33.33 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  31.63 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  31.96 
 
 
99 aa  47  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0358  hypothetical protein  43.33 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  30.21 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0823  hypothetical protein  31.82 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.636113  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  29.87 
 
 
102 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  30.93 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  27.37 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0458  hypothetical protein  30.26 
 
 
105 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42868  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  29.59 
 
 
95 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  31.37 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4004  protein of unknown function DUF1330  33.33 
 
 
157 aa  43.9  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0358  hypothetical protein  33.8 
 
 
214 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0495198  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0040  protein of unknown function DUF1330  29.35 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000083486 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  30.53 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  33.67 
 
 
102 aa  43.5  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  33.67 
 
 
102 aa  43.5  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  33.67 
 
 
102 aa  43.5  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2191  protein of unknown function DUF1330  29.47 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  29.63 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  29.63 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  28.57 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  30.61 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  27.59 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  26.32 
 
 
96 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0434  hypothetical protein  31.88 
 
 
103 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  29.47 
 
 
96 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  29.87 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  34.33 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  31.75 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3118  protein of unknown function DUF1330  33.33 
 
 
157 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  30.53 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  29.9 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>