60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1336 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  194  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  51.04 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  51.04 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  51.04 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0358  hypothetical protein  51.69 
 
 		 104 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5218  hypothetical protein  34.74 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1452  hypothetical protein  39.56 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  35.11 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  34.04 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  30.85 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  29.47 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  35.87 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  34.69 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  35.71 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  31.76 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  28.72 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  39.47 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  25.53 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  28.26 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  33.67 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  35.9 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  30.85 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  33.33 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  33.67 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  25.53 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  32.65 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  41.46 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  35.06 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  32.65 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  33.7 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  31.58 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0040  protein of unknown function DUF1330  38.04 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000083486 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  31.63 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  24.21 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1901  hypothetical protein  35.92 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00121592  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  28.12 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  32.63 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12241  hypothetical protein  29.55 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  31.52 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  27.17 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0668  protein of unknown function DUF1330  29.41 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0495537  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  27.66 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0724  hypothetical protein  27.47 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  27.17 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  28.09 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  25 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  31.52 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  27.91 
 
 		 95 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  28.12 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  28.42 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  28.26 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  28.26 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  28.57 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  32.61 
 
 		 96 aa  40.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  26.74 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3978  glucose inhibited division protein  27.96 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.174401 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  26.74 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11881  hypothetical protein  29.21 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  26.09 
 
 		 96 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  26.6 
 
 		 96 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>