56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_11881 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_11881  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  232  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0461  hypothetical protein  82.14 
 
 
113 aa  191  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11761  hypothetical protein  82.14 
 
 
113 aa  189  8e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0410436 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06361  hypothetical protein  76.99 
 
 
114 aa  188  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.481092 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1498  hypothetical protein  78.57 
 
 
113 aa  187  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03931  hypothetical protein  77.88 
 
 
113 aa  183  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.719494  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12241  hypothetical protein  48.39 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06041  hypothetical protein  49.47 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.497862 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14371  hypothetical protein  40.43 
 
 
106 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.595341  hitchhiker  0.00388009 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10681  hypothetical protein  40.45 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0504465 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0386  hypothetical protein  40.23 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.474564  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  36.73 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11051  hypothetical protein  34.15 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0800045  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  36.36 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  34.34 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11101  hypothetical protein  32.93 
 
 
94 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.223002  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1029  hypothetical protein  32.93 
 
 
94 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0107339  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11111  hypothetical protein  32.93 
 
 
94 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  34.74 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  38.1 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  28.09 
 
 
95 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  30.21 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  31.58 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  33 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  36.46 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2371  hypothetical protein  31.87 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.762767  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2667  protein of unknown function DUF1330  34.31 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2304  hypothetical protein  34.34 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  30.21 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  33.78 
 
 
96 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  33 
 
 
100 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  30.53 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  35.71 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  30.53 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  30.85 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  29.47 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  26.97 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  28.12 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  29.79 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  30.93 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  27.08 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  29.67 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0040  protein of unknown function DUF1330  29.47 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000083486 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  29.67 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  32.08 
 
 
103 aa  42.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  29 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12491  hypothetical protein  32.26 
 
 
121 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0458  hypothetical protein  27.08 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42868  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  31 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2309  hypothetical protein  34.62 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0358  hypothetical protein  31.31 
 
 
214 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0495198  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1905  hypothetical protein  27.66 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682108  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  22.47 
 
 
95 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  29.21 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  27.66 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1988  hypothetical protein  34.21 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332704  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>