54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1498 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1498  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  234  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03931  hypothetical protein  85.71 
 
 
113 aa  204  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.719494  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0461  hypothetical protein  83.19 
 
 
113 aa  201  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11761  hypothetical protein  82.3 
 
 
113 aa  199  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0410436 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11881  hypothetical protein  78.57 
 
 
113 aa  187  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06361  hypothetical protein  65.18 
 
 
114 aa  164  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.481092 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06041  hypothetical protein  44.21 
 
 
99 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.497862 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12241  hypothetical protein  40.82 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  35.35 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14371  hypothetical protein  38.38 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.595341  hitchhiker  0.00388009 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10681  hypothetical protein  40.7 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0504465 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  33.33 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0386  hypothetical protein  40.48 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.474564  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  28.89 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  31.63 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  31 
 
 
100 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11051  hypothetical protein  34.15 
 
 
105 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0800045  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0040  protein of unknown function DUF1330  32.63 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000083486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  28.57 
 
 
95 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11101  hypothetical protein  35.06 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.223002  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11111  hypothetical protein  35.06 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1029  hypothetical protein  35.06 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0107339  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  27.72 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  31.91 
 
 
102 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  34 
 
 
112 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2667  protein of unknown function DUF1330  34.65 
 
 
97 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2304  hypothetical protein  35.71 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  27.47 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  27.84 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  28 
 
 
95 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  30.3 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1905  hypothetical protein  27.08 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682108  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2371  hypothetical protein  28.21 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.762767  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  27 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  27 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  25 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  26.32 
 
 
97 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  26.92 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5218  hypothetical protein  31.52 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7205  protein of unknown function DUF1330  36.59 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  26.92 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  26.26 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  28.38 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  25 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  36.59 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  27.66 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  29.59 
 
 
97 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  27.37 
 
 
95 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  21.11 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  25.25 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  26.6 
 
 
96 aa  40  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12491  hypothetical protein  34.74 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>