83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0040 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0040  protein of unknown function DUF1330  100 
 
 		 95 aa  186  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000083486 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  42.11 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  42.55 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  41.05 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  39.58 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  39.36 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1007  protein of unknown function DUF1330  41.67 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0223  hypothetical protein  41.3 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0195535  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0958  hypothetical protein  41.3 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0421  hypothetical protein  41.3 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1378  hypothetical protein  41.3 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  36.17 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  36.17 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1874  hypothetical protein  41.3 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1789  hypothetical protein  41.3 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35863  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0338  hypothetical protein  41.3 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418889  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  34.38 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0358  hypothetical protein  35.48 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0495198  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  36.17 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  36.17 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  35.79 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  35.79 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  37.89 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  32.63 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  33.68 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  32.63 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2304  hypothetical protein  39.58 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  34.74 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0434  hypothetical protein  36.46 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  35.11 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  36.17 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1498  hypothetical protein  32.63 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  32.98 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  31.58 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0461  hypothetical protein  31.71 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  33.68 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  39.13 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  33.68 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  39.13 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  39.13 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11761  hypothetical protein  31.71 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0410436 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  31.91 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  35.11 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03931  hypothetical protein  29.47 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.719494  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  35.11 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  32.26 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  38.04 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  32.84 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2667  protein of unknown function DUF1330  38.38 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  33.68 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  32.63 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  33.68 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  38.37 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  29.67 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  32.98 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5218  hypothetical protein  27.17 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2371  hypothetical protein  38.96 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.762767  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  31.25 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5111  hypothetical protein  31.82 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  30.43 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06041  hypothetical protein  29.47 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.497862 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  37.66 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  37.66 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  28.57 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  30.93 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  31.52 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1641  hypothetical protein  32.97 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825876  hitchhiker  0.000000345307 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11881  hypothetical protein  29.47 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  29.35 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  30.11 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1754  hypothetical protein  30.85 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  27.17 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  32.29 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  29.17 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  28.26 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2475  hypothetical protein  35.42 
 
 		 94 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.901733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7205  protein of unknown function DUF1330  34.74 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5042  hypothetical protein  35 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.662041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1504  hypothetical protein  26.09 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  31.52 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  27.08 
 
 		 102 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1988  hypothetical protein  30.43 
 
 		 95 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4093  hypothetical protein  37.89 
 
 		 97 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>