93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1754 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1754  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  229  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  73.68 
 
 		 114 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  76.24 
 
 		 114 aa  164  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1519  protein of unknown function DUF1330  78.07 
 
 		 114 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.407227 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1800  protein of unknown function DUF1330  77.19 
 
 		 114 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472957  normal  0.250055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1521  hypothetical protein  77.19 
 
 		 114 aa  152  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.997326  normal  0.585973 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  59.8 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0434  hypothetical protein  58.25 
 
 		 103 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  57 
 
 		 100 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  61.17 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  58.82 
 
 		 102 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  57.73 
 
 		 97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  53 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  59.57 
 
 		 95 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  58.51 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  53.19 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  55.32 
 
 		 95 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  56.38 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  54.26 
 
 		 95 aa  103  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  54.26 
 
 		 95 aa  103  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  49.48 
 
 		 97 aa  97.4  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  51.58 
 
 		 97 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  49.47 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  48.94 
 
 		 94 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0358  hypothetical protein  49.47 
 
 		 214 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0495198  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  48.39 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  50.52 
 
 		 98 aa  90.9  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  49.46 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  51.61 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  48.96 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1937  hypothetical protein  51.58 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0325431 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  49.46 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  49.46 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  46.24 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2371  hypothetical protein  48.39 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.762767  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  47.25 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  46.59 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  45.83 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  45.45 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1641  hypothetical protein  41.3 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825876  hitchhiker  0.000000345307 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  41.49 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  39.36 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  43.48 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1988  hypothetical protein  43.01 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7205  protein of unknown function DUF1330  37.11 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  40.66 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  39.58 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2667  protein of unknown function DUF1330  40.21 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1789  hypothetical protein  31.18 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35863  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  35.79 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0338  hypothetical protein  31.18 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418889  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1874  hypothetical protein  31.18 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446386  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0417  hypothetical protein  37.89 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2304  hypothetical protein  37.11 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  36.26 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  35.16 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2189  protein of unknown function DUF1330  37.89 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.321653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  36.84 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  32.26 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  34.74 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  35.16 
 
 		 95 aa  52.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1378  hypothetical protein  34.04 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0421  hypothetical protein  34.04 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0223  hypothetical protein  34.04 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0195535  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0958  hypothetical protein  34.04 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4093  hypothetical protein  35.79 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  36.84 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  36.84 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  34.34 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  32.63 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  34.74 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  33.68 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4724  hypothetical protein  34.02 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1007  protein of unknown function DUF1330  37.89 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1128  hypothetical protein  34.74 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  37.5 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12241  hypothetical protein  27.96 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  30.53 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  32.63 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0727  hypothetical protein  30.68 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  29.55 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  31.58 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  31.58 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0310  hypothetical protein  33.75 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  35.16 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1905  hypothetical protein  35.11 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0040  protein of unknown function DUF1330  30.85 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000083486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5042  hypothetical protein  30.59 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.662041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06041  hypothetical protein  27.37 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.497862 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1432  hypothetical protein  33.75 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  29.29 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3241  protein of unknown function DUF1330  29.55 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4630  protein of unknown function DUF1330  38.24 
 
 		 109 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>