65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4630 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4630  protein of unknown function DUF1330  100 
 
 		 109 aa  221  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  54.08 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  48.51 
 
 		 115 aa  106  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  45.37 
 
 		 112 aa  103  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  46.53 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  46.53 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  47.52 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  46.53 
 
 		 106 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  46.53 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  46.53 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  45.54 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  44.55 
 
 		 133 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1901  hypothetical protein  47.37 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00121592  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  37.93 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3354  hypothetical protein  45.21 
 
 		 73 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10898  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  47.14 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  36.73 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  35.71 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  35.48 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  37.97 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  37.89 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  35 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  36.59 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  32.26 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  35.8 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  35.11 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  36.36 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  34.02 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  35.11 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  35.11 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  32.65 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  34.31 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2309  hypothetical protein  27.78 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  28 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  36.73 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  43.4 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  30.43 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  35.11 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  43.4 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  30.93 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0823  hypothetical protein  33.7 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.636113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  31.58 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  30.53 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  32.29 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  30.21 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  30.69 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  31.58 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0105  hypothetical protein  31.65 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.771179 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  32.26 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  29.79 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  29.79 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  39.62 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  39.62 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  39.62 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  34.04 
 
 		 96 aa  42.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  35.29 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3978  glucose inhibited division protein  34.04 
 
 		 96 aa  42.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.174401 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12241  hypothetical protein  29.55 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0458  hypothetical protein  31.33 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42868  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  32.29 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  26.67 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7719  hypothetical protein  40.38 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0358  hypothetical protein  29.35 
 
 		 214 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0495198  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1754  hypothetical protein  38.24 
 
 		 114 aa  40  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>