70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0823 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0823  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  210  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.636113  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  62.64 
 
 
96 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  58.89 
 
 
95 aa  117  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  41.76 
 
 
106 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  40.86 
 
 
115 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  34.83 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  35.29 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  36.56 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  37.21 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1347  hypothetical protein  35.11 
 
 
97 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  37.21 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  34.44 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0603  protein of unknown function DUF1330  34.04 
 
 
96 aa  51.6  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  35 
 
 
92 aa  51.6  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  34.44 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  41.1 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0958  hypothetical protein  33.71 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1378  hypothetical protein  33.71 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0421  hypothetical protein  33.71 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0223  hypothetical protein  33.71 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0195535  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  35.56 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  37.5 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  30 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0338  hypothetical protein  32.58 
 
 
98 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418889  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1789  hypothetical protein  32.58 
 
 
98 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35863  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1874  hypothetical protein  32.58 
 
 
98 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446386  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  35.53 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  36.99 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  30.68 
 
 
95 aa  48.1  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  34.52 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  34.52 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  33.7 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3354  hypothetical protein  42.59 
 
 
73 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10898  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  44.44 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  29.41 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  29.47 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4630  protein of unknown function DUF1330  33.33 
 
 
109 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  34.44 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  34.09 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  32.98 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  34.12 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  30.67 
 
 
96 aa  43.5  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  28.89 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  34.74 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  27.27 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  28.09 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  30.59 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3978  glucose inhibited division protein  32.22 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.174401 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  27.27 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3894  hypothetical protein  38.67 
 
 
94 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1641  hypothetical protein  32.22 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825876  hitchhiker  0.000000345307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  32.63 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  30.34 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  25.68 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  30 
 
 
95 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5042  hypothetical protein  31.51 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.662041  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2846  hypothetical protein  32.14 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  30.43 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  34.15 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  26.67 
 
 
96 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0724  hypothetical protein  40.74 
 
 
129 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  30.86 
 
 
96 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>