52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5163 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  86.79 
 
 
106 aa  187  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  84.91 
 
 
133 aa  184  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  84.91 
 
 
106 aa  183  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  84.91 
 
 
106 aa  183  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  84.91 
 
 
106 aa  183  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  74.53 
 
 
106 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  61.9 
 
 
115 aa  130  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  56.19 
 
 
107 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  53.4 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1901  hypothetical protein  52.38 
 
 
106 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00121592  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  51.61 
 
 
112 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4630  protein of unknown function DUF1330  46.53 
 
 
109 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  51.72 
 
 
89 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3354  hypothetical protein  58.9 
 
 
73 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10898  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  36.08 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  32.65 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  32.98 
 
 
100 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  36.46 
 
 
97 aa  52  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  34.02 
 
 
95 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  35.71 
 
 
96 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  31.96 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  29.47 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  32.29 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  32.53 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  30.95 
 
 
95 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  33.68 
 
 
99 aa  47  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  30.53 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0040  protein of unknown function DUF1330  30.43 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000083486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  34.44 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  31.96 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  30.86 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2191  protein of unknown function DUF1330  32.26 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  34.38 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  30.23 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  39.22 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0434  hypothetical protein  29.87 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  26.32 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4004  protein of unknown function DUF1330  33.33 
 
 
157 aa  43.5  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  29.87 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  31.96 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0823  hypothetical protein  31.82 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.636113  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  30.53 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0358  hypothetical protein  30.95 
 
 
214 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0495198  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  32.65 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0458  hypothetical protein  30.26 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42868  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  27.27 
 
 
102 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0358  hypothetical protein  32.56 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  28.42 
 
 
97 aa  41.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  29.29 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  30.53 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  25.26 
 
 
96 aa  40  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>