15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0603 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0603  protein of unknown function DUF1330  100 
 
 		 96 aa  199  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1347  hypothetical protein  63.16 
 
 		 97 aa  132  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  35.48 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  38.37 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  33.33 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0823  hypothetical protein  34.04 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.636113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  35.8 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  36.99 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  27.47 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  28.57 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  30.43 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  28.57 
 
 		 91 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5042  hypothetical protein  28.92 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.662041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  29.67 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>