111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1042 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  42.31 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  36.17 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  36.9 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  36.17 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  38.95 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  36.84 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  41.24 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2309  hypothetical protein  36.96 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  44.87 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  39.58 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  44.44 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  43.62 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4630  protein of unknown function DUF1330  47.14 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  36.84 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  35.16 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  35.42 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  38.54 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  40.62 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  34.38 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  39.78 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  34.02 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  37.5 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3978  glucose inhibited division protein  35.71 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.174401 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  36.84 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  36.84 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  34.38 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  39.36 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  36.46 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  31.03 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  36.46 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  32.94 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7719  hypothetical protein  39.29 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  34.38 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0310  hypothetical protein  33.77 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  32.63 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  33.68 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1901  hypothetical protein  41.03 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00121592  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  32.29 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  35.79 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0603  protein of unknown function DUF1330  38.37 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  32.63 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  36.11 
 
 		 92 aa  52  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  34.74 
 
 		 95 aa  52  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  36.46 
 
 		 106 aa  52  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  36.59 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  35.37 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  35.37 
 
 		 114 aa  52  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  37.5 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  36.84 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  34.83 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  32.63 
 
 		 96 aa  50.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  30.93 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  32.63 
 
 		 96 aa  50.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  40.22 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  40.22 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  34.74 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  34.83 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  33.68 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  32.63 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  33.72 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  33.72 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  38.27 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  33.72 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  34.74 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  35.29 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1128  hypothetical protein  31.58 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  29.17 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  32.63 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  36.59 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1641  hypothetical protein  33.68 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825876  hitchhiker  0.000000345307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  32.63 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  33.68 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4004  protein of unknown function DUF1330  36.92 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  32.5 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2371  hypothetical protein  39.13 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.762767  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  36.59 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0338  hypothetical protein  34.74 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418889  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1874  hypothetical protein  34.74 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1789  hypothetical protein  34.74 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35863  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5042  hypothetical protein  33.72 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.662041  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0958  hypothetical protein  34.74 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1988  hypothetical protein  35.29 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0421  hypothetical protein  34.74 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0223  hypothetical protein  34.74 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0195535  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1378  hypothetical protein  34.74 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  30.95 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3241  protein of unknown function DUF1330  31.96 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0105  hypothetical protein  32.29 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.771179 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1452  hypothetical protein  30.93 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  33.75 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  30.61 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  35.53 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3354  hypothetical protein  34.25 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10898  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  34.52 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  32.93 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0668  protein of unknown function DUF1330  29.17 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0495537  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0727  hypothetical protein  32.99 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12241  hypothetical protein  32.95 
 
 		 115 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1347  hypothetical protein  33.78 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>